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Enregistrement W3081623395 · doi:10.3390/jof6040216

Diagnosis of Breakthrough Fungal Infections in the Clinical Mycology Laboratory: An ECMM Consensus Statement

2020· article· en· W3081623395 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueJournal of Fungi · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAntifungal resistance and susceptibility
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilDa VolterraShionogiDeutsche ForschungsgemeinschaftNabriva TherapeuticsRegeneron PharmaceuticalsAmplyxWellcome TrustCidara TherapeuticsAstellas PharmaMylanMedpaceGilead SciencesPfizer
Mots-clésMedical mycologyIntensive care medicineSerologyAspergillosisMedicineAntifungalBiologyImmunologyDermatologyMicrobiologyAntibody

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Breakthrough invasive fungal infections (bIFI) cause significant morbidity and mortality. Their diagnosis can be challenging due to reduced sensitivity to conventional culture techniques, serologic tests, and PCR-based assays in patients undergoing antifungal therapy, and their diagnosis can be delayed contributing to poor patient outcomes. In this review, we provide consensus recommendations on behalf of the European Confederation for Medical Mycology (ECMM) for the diagnosis of bIFI caused by invasive yeasts, molds, and endemic mycoses, to guide diagnostic efforts in patients receiving antifungals and support the design of future clinical trials in the field of clinical mycology. The cornerstone of lab-based diagnosis of breakthrough infections for yeast and endemic mycoses remain conventional culture, to accurately identify the causative pathogen and allow for antifungal susceptibility testing. The impact of non-culture-based methods are not well-studied for the definite diagnosis of breakthrough invasive yeast infections. Non-culture-based methods have an important role for the diagnosis of breakthrough invasive mold infections, in particular invasive aspergillosis, and a combination of testing involving conventional culture, antigen-based assays, and PCR-based assays should be considered. Multiple diagnostic modalities, including histopathology, culture, antibody, and/or antigen tests and occasionally PCR-based assays may be required to diagnose breakthrough endemic mycoses. A need exists for diagnostic tests that are effective, simple, cheap, and rapid to enable the diagnosis of bIFI in patients taking antifungals.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil0,247

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,084
Tête enseignante GPT0,400
Écart entre enseignants0,316 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle