Characterization of Genomic Microsatellite Markers and Analysis of Pollen Donors Number for Single Cone of Chinese fir
Notice bibliographique
Résumé
Chinese fir [ Cunninghamia lanceolate (Lamb.) Hook] is one of the most important indigenous timber tree species in China. The aim of the present work is to characterize simple sequence repeat (SSR) loci derived from the specific length amplified fragment sequencing (SLAF) data of the genome and to investigate the number of pollen donors for per cone was with novel SSR markers of low-frequency null alleles. A total of 58855 SLAF-SSR with frequency of 42.04 SSR/Mbp were identified in about 1.40 Gb Chinese fir genome. Dinucleotide repeat SSR contributed to 66.4% of the total SSR from SLAF data. The AT/AT and ATG/CAT motifs were predominant in the category of din- and trinucleotide repeat SSR. Low frequencies of null alleles (<5%) were detected at the nine novel SSR markers with average expected heterozygosity of 0.513 and polymorphism information content score of 0.508. The number of tested progeny of a cone was from 4 to 13. It could be 67 pollinizers for 15 cones and the average number of pollen donors per cone was 4.5. The study points out, for the first time, that there are multiple pollen donors for single cone in gymnosperm.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».