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Enregistrement W3082900405 · doi:10.5376/mpb.2020.11.0011

Analysis of Variation in <i>MYB1</i> and <i>MYB10</i> in Several <i>Malus</i> Plants

2020· article· en· W3082900405 sur OpenAlexvenueno aff
Chao Ma, Yifan Bu, Chenghui Zhang, Hongzheng Ma, Baoquan Hu

Notice bibliographique

RevueMolecular Plant Breeding · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Gene Expression Analysis
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesChinese Academy of Agricultural SciencesTianjin UniversityNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésMalusBiologyAlleleGeneticsGenePolymorphism (computer science)Botany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

For the study of the polymorphism and evolutionary characteristics of MYB1 and its allele MYB10 involved in the regulation of anthocyanin biosynthesis in genus Malus . The MYB1 and MYB10 gene sequences amplified by RT-PCR technology in several Malus plants were sequenced and predicted for their protein structures to detect the differences. Six MYB1 sequences were obtained and the full-length CDS were 1 239 bp except for those of Malus cv. Eleyi and Malus sieversii (1 209 bp). While nine MYB10 were sequenced and the full-length CDS were 732 bp ( Malus micromalus was 717 bp). The result from the comparison of protein sequences of MYB1 and MYB10 showed that the polymorphism of MYB1 was significantly higher than MYB10 and the polymorphism difference between the alleles may be related to the differentiation of gene function. Two polymorphism sites, the interchange of alkaline arginine and non-polar leucine, located on functional domain which may affect the function of MYB1 in different Malus plants. The result suggested that sequence conservatism of the allele MYB10 and MYB1 significantly differed from each other, and the genetic function responsible for evolution was differentiated. The result can provide further theoretical basis for the study of the gene function and regulation mechanism of apple fruit color.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesMéta-épidémiologie (sens strict)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,410
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0020,003
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,224
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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