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Enregistrement W3083296688 · doi:10.1101/2020.09.04.20187575

Genome-wide analysis identifies significant contribution of brain-expressed genes in chronic, but not acute, back pain

2020· preprint· en· W3083296688 sur OpenAlexafffund
Andrey V. Bortsov, Marc Parisien, Samar Khoury, Dmitri V. Zaykin, Amy E. Martinsen, Marie Udnesseter Lie, Ingrid Heuch, Kristian Hveem, John‐Anker Zwart, Bendik S Winsvold, Luda Diatchenko

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMusculoskeletal pain and rehabilitation
Établissements canadiensMcGill UniversityMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesNorwegian Institute of Public HealthStatens Serum InstitutFakultet for medisin og helsevitenskap, Norges Teknisk-Naturvitenskapelige UniversitetNorges ForskningsrådHelse Midt-NorgeCanada Excellence Research Chairs, Government of CanadaNational Institutes of HealthFaculty of Medicine and Health, University of SydneyNorges Teknisk-Naturvitenskapelige Universitet
Mots-clésChronic painBack painAcute painMedicineCohortGenome-wide association studyBioinformaticsGeneBiologyGeneticsInternal medicinePhysical therapySingle-nucleotide polymorphismAnesthesiaPathologyGenotypeAlternative medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Back pain is the leading cause of disability worldwide. Although most cases of back pain are acute, 20% of people with acute back pain go on to experience chronic back pain symptoms. It is unclear if acute and chronic pain states have similar or distinct underlying genetic mechanisms. Here we performed a genome-wide analysis for acute and chronic back pain in 375,158 individuals and found a significant genetic contribution to chronic, but not to acute, back pain. Using the UK Biobank cohort for discovery and the HUNT cohort for replication, we identified 7 loci for chronic back pain, of which 3 are novel. Pathway analyses, tissue-specific heritability enrichment analyses, epigenetic characterization, and tissue-specific transcriptome mapping in mouse pain models suggest a substantial genetic contribution to chronic, but not acute, back pain from the loci predominantly expressed in the central nervous system. Our findings show that chronic back pain is more heritable than acute back pain and is driven mostly by genes expressed in the central nervous system.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,282
Écart entre enseignants0,264 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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