Evidence for the Accumulation of Nonsynonymous Mutations and Favorable Pleiotropic Alleles During Wheat Breeding
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Plant breeding leads to the genetic improvement of target traits by selecting a small number of genotypes from among typically large numbers of candidate genotypes after careful evaluation. In this study, we first investigated how mutations at conserved nucleotide sites normally viewed as deleterious, such as nonsynonymous sites, accumulated in a wheat, Triticum aestivum, breeding lineage. By comparing a 150 year old ancestral and modern cultivar, we found recent nucleotide polymorphisms altered amino acids and occurred within conserved genes at frequencies expected in the absence of purifying selection. Mutations that are deleterious in other contexts likely had very small or no effects on target traits within the breeding lineage. Second, we investigated if breeders selected alleles with favorable effects on some traits and unfavorable effects on others and used different alleles to compensate for the latter. An analysis of a segregating population derived from the ancestral and modern parents provided one example of this phenomenon. The recent cultivar contains the Rht-B1b green revolution semi-dwarfing allele and compensatory alleles that reduce its negative effects. However, improvements in traits other than plant height were due to pleiotropic loci with favorable effects on traits and to favorable loci with no detectable pleiotropic effects. Wheat breeding appears to tolerate mutations at conserved nucleotide sites and to only select for alleles with both favorable and unfavorable effects on traits in exceptional situations.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».