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Enregistrement W3085497423 · doi:10.1111/febs.15562

Metabolism as a central regulator of β‐cell chromatin state

2020· review· en· W3085497423 sur OpenAlexafffund
Ben Vanderkruk, Brad G. Hoffman

Notice bibliographique

RevueFEBS Journal · 2020
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePancreatic function and diabetes
Établissements canadiensBC Children's HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesInstitute of Nutrition, Metabolism and DiabetesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésChromatinCell biologyBiologyCell metabolismRegulatorGene expressionRegulation of gene expressionChromatin remodelingCellMetabolismCell fate determinationCell typeTranscription factorGeneBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Pancreatic β-cells are critical mediators of glucose homeostasis in the body, and proper cellular nutrient metabolism is critical to β-cell function. Several interacting signaling networks that uniquely control β-cell metabolism produce essential substrates and co-factors for catalytic reactions, including reactions that modify chromatin. Chromatin modifications, in turn, regulate gene expression. The reactions that modify chromatin are therefore well-positioned to adjust gene expression programs according to nutrient availability. It follows that dysregulation of nutrient metabolism in β-cells may impact chromatin state and gene expression through altering the availability of these substrates and co-factors. Metabolic disorders such as type 2 diabetes (T2D) can significantly alter metabolite levels in cells. This suggests that a driver of β-cell dysfunction during T2D may be the altered availability of substrates or co-factors necessary to maintain β-cell chromatin state. Induced changes in the β-cell chromatin modifications may then lead to dysregulation of gene expression, in turn contributing to the downward cascade of events that leads to the loss of functional β-cell mass, and loss of glucose homeostasis, that occurs in T2D.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,954
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,300
Écart entre enseignants0,274 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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