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Enregistrement W3086081047 · doi:10.1111/ene.14533

Rapid and accurate diagnosis of brain abscess caused by <i>Nocardia asiatica</i> with a combination of Ziehl‐Neelsen staining and metagenomics next‐generation sequencing

2020· article· en· W3086081047 sur OpenAlexaff
Tao Huang, Yin-Hao Chen, Jinnong Zhang, Ruijuan He, Dianbo Qu, Qinyong Ye, X Chen

Notice bibliographique

RevueEuropean Journal of Neurology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueActinomycetales infections and treatment
Établissements canadiensHotchkiss Brain InstituteUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineZiehl–Neelsen stainBrain abscessLinezolidAbscessStainingGram stainingNocardiosisPathologyNocardiaSurgeryStaphylococcus aureusTuberculosisAntibioticsVancomycinAcid-fastMicrobiologyBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND AND PURPOSE: Early and accurate diagnosis is vital in cerebral nocardiosis, a very rare and infectious disease associated with a high mortality rate. Herein, we report a case that a patient with brain abscess was swiftly diagnosed and successfully treated. METHODS: We report a case of a 61-year-old woman with a brain abscess caused by Nocardia asiatica, diagnosed by a combination of Ziehl-Neelsen staining and metagenomics next-generation sequencing (mNGS). RESULTS: A 61-year-old woman with left breast cancer resection, diabetes mellitus and a 7-month discontinuous cough and fever was admitted to our hospital. On the third day of hospitalization, she experienced a sudden loss of consciousness and was diagnosed with a brain abscess and a pathological change in cerebral mass on brain magnetic resonance imaging (MRI). Due to the failure of culturing any microorganisms from the pup, the dissected sample from the patient with Ziehl-Neelsen staining tested positive for acid-fast bacilli and was subjected to mNGS. The pathogen was identified as N. asiatica and the patient was treated accordingly with linezolid and trimethoprim-sulfamethoxazole until complete recovery was confirmed by the follow-up cerebral MRI. CONCLUSIONS: This is the first case report of a brain abscess caused by N. asiatica being swiftly diagnosed by a combination of Ziehl-Neelsen staining and mNGS. This rapid diagnosis allowed us to successfully treat this rare infection.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,414
Score d'incertitude au seuil0,327

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,061
Tête enseignante GPT0,253
Écart entre enseignants0,192 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations25
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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