MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3090916012 · doi:10.3389/fimmu.2020.583820

Polyfunctional Fc Dependent Activity of Antibodies to Native Trimeric Envelope in HIV Elite Controllers

2020· article· en· W3090916012 sur OpenAlexafffund
Sanket Kant, Ningyu Zhang, Alexandre Barbé, Jean‐Pierre Routy, Cécile Tremblay, Réjean Thomas, Jason Szabo, Pierre Côté, Benoît Trottier, Roger LeBlanc, Danielle Rouleau, Marianne Harris, Franck P. Dupuy, Nicole F. Bernard

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Immunology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueHIV Research and Treatment
Établissements canadiensAIDS VancouverCentre Hospitalier de l’Université de MontréalMcGill UniversityUniversité de MontréalMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesFonds de Recherche du Québec - SantéCanadian Institutes of Health ResearchMcGill University Health CentreMcGill University
Mots-clésAntibody-dependent cell-mediated cytotoxicityTetherinAntibodyEpitopeVirologyImmune systemBiologyHIV vaccineImmunologyCell cultureViral envelopeMonoclonal antibodyVaccine trial

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Antibody dependent (AD) functions such as AD cellular cytotoxicity (ADCC) were associated with lower viral load (VL) in untreated HIV progressors and protection from HIV infection in the modestly protective RV144 HIV vaccine trial. Target cells used to measure ADCC, AD complement deposition (ADCD) and AD cellular trogocytosis (ADCT) have been either HIV envelope (Env) gp120-coated CEM.NKr.CCR5 cells or HIV infected cell cultures. In HIV infected cell cultures, uninfected bystander cells take up gp120 shed from infected cells. Both gp120-coated and gp120+ bystander cells expose CD4 induced (CD4i) epitopes, which are normally hidden in native trimeric Env expressed by genuinely HIV infected cells since Nef and Vpu downmodulate cell surface CD4. AD assays using either of these target cells probe for CD4i Abs that are abundant in HIV+ plasma but that do not recognize HIV-infected cells. Here, we examined ADCC, ADCD and ADCT functions using a target cell line, siCEM cells, whose HIV infection frequency nears 100% and that expresses HIV Env in a native trimeric closed conformation. Using siCEM cells as targets, we probed the binding and AD functions of anti-gp120/Env Abs in plasma from HIV-infected untreated progressor (UTP, n=18) and treated (TP, n=24) subjects, compared to that in Elite Controllers (EC, n=37) and Viral Controllers (VC, n=16), which are rare subsets of HIV-infected individuals who maintain undetectable or low VL, respectively, without treatment. Gp120-coated beads were used to measure AD cellular phagocytosis (ADCP). Equivalent concentrations of input IgG in plasma from UTPs, ECs, and VCs supported higher levels of all AD functions tested than plasma from TPs. When AD activities were normalized to the concentration of anti-gp120/Env-specific Abs, between-group differences largely disappeared. This finding suggests that the anti-gp120/Env Abs concentrations and not their potency determined AD functional levels in these assays. ECs did differ from the other groups by having AD functions that were highly polyfunctional and highly correlated with each other. PCR measurement of HIV reservoir size showed that ADCC activity was higher in ECs and VCs with a reservoir size below the limit of detection compared to those having a measurable HIV reservoir size.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,250
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueFrontiers in ImmunologyMême sujetHIV Research and TreatmentTravaux en français237 207