Impact of an unusual disulfide transformation on detection of isothermal amplification products
Notice bibliographique
Résumé
Detection of infectious pathogens such as HIV-1, HPV, and SARS-CoV-2 from biospecimens is critical to healthcare. Particularly sensitive and specific diagnostic techniques to accomplish this include molecular amplification and detection tests of nucleic acids from pathogens. Such tests are comprised of reagent compositions to facilitate hybridization of primers and probes that are complementary to specifically amplified sequences of the analyte target. One of these reagents from an isothermal molecular assay occasionally changed its physical appearance over time, generating interest into the cause of the transformation and suitability of the reagent in diagnostic testing. A preliminary hypothesis was that the 2,2′-dithiodipyridine component was the pre-chromophoric compound of its distinctly yellow reduced form, 2-thiopyridine. However, under oxidizing conditions, 2-thiopyridine is a minor constituent of hybridization reagents and not a major contributor to the yellow colour. Instead, a new yellow compound was isolated from coloured hybridization reagent, identified as 1-(2′-pyridyl)-2-thiopyridone and determined to be the result of an intramolecular cyclic rearrangement and sulfur extrusion from 2,2′-dithiodipyridine under acidic and oxidizing conditions. Neither the appearance of 1-(2′-pyridyl)-2-thiopyridone, nor the concomitant depletion of 2,2′-dithiodipyridine reduced the sensitivity or specificity of in vitro diagnostic screening assay results for detecting amplified nucleic acids from viral pathogens, ensuring the safety of tested blood transfusion products.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».