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Enregistrement W3092226358 · doi:10.1158/2326-6066.cir-20-0527

The Prognostic Role of Macrophage Polarization in the Colorectal Cancer Microenvironment

2020· article· en· W3092226358 sur OpenAlexfundno aff
Juha P. Väyrynen, Koichiro Haruki, Mai Chan Lau, Sara A. Väyrynen, Rong Zhong, Andressa Dias Costa, Jennifer Borowsky, Melissa Zhao, Kenji Fujiyoshi, Kota Arima, Tyler S. Twombly, Junko Kishikawa, Simeng Gu, Saina Aminmozaffari, Shanshan Shi, Yoshifumi Baba, Naohiko Akimoto, Tomotaka Ugai, Annacarolina da Silva, Jennifer L. Guerriero, Mingyang Song, Kana Wu, Andrew T. Chan, Reiko Nishihara, Charles S. Fuchs, Jeffrey A. Meyerhardt, Marios Giannakis, Shuji Ogino, Jonathan A. Nowak

Notice bibliographique

RevueCancer Immunology Research · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune cells in cancer
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesGary Bennett Family FundSuomen KulttuurirahastoStand Up To CancerUehara Memorial FoundationNational Institutes of HealthOrionin TutkimussäätiöAmerican Institute for Cancer ResearchNational Cancer InstituteEntertainment Industry FoundationMitsukoshi Health and Welfare FoundationAmerican Association for Cancer ResearchAmerican Society of Clinical OncologyJapan Society for the Promotion of ScienceCancer Research UKConquer Cancer Foundation
Mots-clésTumor microenvironmentColorectal cancerMedicineCancer researchMacrophage polarizationCancerMacrophageImmunologyOncologyImmune systemInternal medicineBiologyIn vitro

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Macrophages are among the most common cells in the colorectal cancer microenvironment, but their prognostic significance is incompletely understood. Using multiplexed immunofluorescence for CD68, CD86, IRF5, MAF, MRC1 (CD206), and KRT (cytokeratins) combined with digital image analysis and machine learning, we assessed the polarization spectrum of tumor-associated macrophages in 931 colorectal carcinomas. We then applied Cox proportional hazards regression to assess prognostic survival associations of intraepithelial and stromal densities of M1-like and M2-like macrophages while controlling for potential confounders, including stage and microsatellite instability status. We found that high tumor stromal density of M2-like macrophages was associated with worse cancer-specific survival, whereas tumor stromal density of M1-like macrophages was not significantly associated with better cancer-specific survival. High M1:M2 density ratio in tumor stroma was associated with better cancer-specific survival. Overall macrophage densities in tumor intraepithelial or stromal regions were not prognostic. These findings suggested that macrophage polarization state, rather than their overall density, was associated with cancer-specific survival, with M1- and M2-like macrophage phenotypes exhibiting distinct prognostic roles. These results highlight the utility of a multimarker strategy to assess the macrophage polarization at single-cell resolution within the tumor microenvironment.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,313
Écart entre enseignants0,285 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations236
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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