Caractérisation du rôle de la petite GTPase Arf6 dans les fonctions du neutrophile : modèle murin cKO Arf6.
Notice bibliographique
Résumé
Lors d'une infection, les neutrophiles (PMNs) sont rapidement recrutés au site inflammatoire grâce à un processus finement régulé pour y exercer leurs fonctions.L'interaction du PMN avec son environnement nécessite l'intégration des signaux extérieurs captés par ses récepteurs transmembranaires faisant intervenir, entre autres, la petite GTPase ADP ribosylation factor-6 (Arf6).Durant mes travaux de thèse, nous nous sommes intéressés à l'étude du rôle d'Arf6 dans les fonctions du PMN.Les résultats obtenus suggèrent qu'Arf6 altère in vitro l'adhésion de la lignée myéloïde PLB-985 différenciée en cellules qui ressemblent à un PMN.Dans le modèle de souris knockout conditionnel d'Arf6 (cKO Arf6), qui élimine spécifiquement l'expression d'Arf6 dans les PMNs, les résultats obtenus suggèrent qu'Arf6 contrôle la migration des PMNs in vivo dans le modèle de la poche d'air (PA) en réponse au lipopolysaccharide (LPS) ou au N-Formylmethionyl-leucyl-phenylalanine (fMLP).De plus, la diminution du recrutement des PMNs observée corrèle avec une réduction des niveaux d'expression des β2 intégrines à la surface des PMNs : le Lymphocyte function-associated antigen-1 (LFA-1) et le Macrophage antigen complex-1 (Mac-1).D'autre part, les PMNs recrutés au niveau des PAs suite à une stimulation au LPS ont été utilisés pour des études ex vivo.Les résultats obtenus montrent une diminution de la phagocytose du zymosan A (opsonisé ou non), de la production des dérivés toxiques de l'oxygène (ROS) et du superoxyde (O2 -), de l'apoptose et du métabolisme énergétique des PMNs issus des souris cKO Arf6 comparés au groupe contrôle.Finalement, nous avons identifié 179 gènes dont l'expression est modulée par Arf6.Parmi ces gènes, neuf codent pour des protéines impliquées dans l'apoptose.L'expression du gène LACC1, impliqué dans le métabolisme énergétique, est le plus diminué dans les PMNs Arf6 KO.De plus, nos résultats sur la lignée THP-1 suggèrent qu'Arf6 est impliquée dans l'expression précoce de la protéine Lacc1 six heures après une stimulation avec le LPS in vitro.L'ensemble de ces résultats montre un nouveau rôle d'Arf6 dans le contrôle du métabolisme énergétique des PMNs et le contrôle de l'expression du gène de la Lacc1.IV Les résultats obtenus au cours de cette étude, nous laissent suggérer qu'Arf6 joue un rôle important dans les PMNs en régulant plusieurs de leurs fonctions entre autres via la modulation de l'expression des 2 intégrines et de l'expression génique.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».