A sedimentary ancient DNA approach to elucidate the Labrador Sea paleoceanography over the last ~130,000 years
Notice bibliographique
Résumé
Long sedimentary ancient DNA (sedaDNA) records from the marine environment are at present a curiosity and their utility in paleoceanographic research is not yet fully explored. Nevertheless, a few studies indicate that this ecogenetic repository represents an untapped source of new information with which paleoclimatic and paleoceanographic variability can be more deeply explored. We have generated a sedaDNA record from a 19.6 m-long sediment core in the Labrador Sea (Eirik Drift, south of Greenland). The record extends from the early Holocene to Marine Isotope Stage 5 (ca. 130,000 years ago), and we characterized several important climatic transitions in this time interval using stable isotope stratigraphy, ice-rafted detritus counts, and dinoflagellate cyst census counts. The primary goal of this investigation was to query the sedaDNA record for a biological indication of the last and penultimate deglaciation, as well as Heinrich events identified between 65,000 and 25,000 years ago. Our metabarcoding strategy targeted a broad diversity of eukaryotic organisms through amplification of the V7 hypervariable region of the small subunit ribosomal RNA (SSU rRNA) gene. The preliminary sedaDNA results indicate that eukaryote ancient DNA is present in all samples investigated, including those dating back to Marine Isotope Stage 5. Furthermore, we identified abundance shifts in Protaspidae (cercozoa), diatoms, dinoflagellates, and marine stramenopiles (amongst others) that may be linked to changes in paleoceanography during the last two deglaciations as well as Heinrich events (HE3, HE4).
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,005 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».