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Enregistrement W3093225483 · doi:10.1089/cmb.2020.0252

Diagnosis of Autism Spectrum Disorder Based on Functional Brain Networks with Deep Learning

2020· article· en· W3093225483 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueJournal of Computational Biology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueFunctional Brain Connectivity Studies
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAutoencoderAutism spectrum disorderArtificial intelligenceComputer scienceDeep learningMachine learningBenchmark (surveying)Artificial neural networkFunctional magnetic resonance imagingAutismPattern recognition (psychology)Set (abstract data type)NeurosciencePsychology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Autism spectrum disorder (ASD) is a neurological and developmental disorder. Traditional diagnosis of ASD is typically performed through the observation of behaviors and interview of a patient. However, these diagnosis methods are time-consuming and can be misleading sometimes. Integrating machine learning algorithms with neuroimages, a diagnosis method, can possibly be established to detect ASD subjects from typical control subjects. In this study, we develop deep learning methods for diagnosis of ASD from functional brain networks constructed with brain functional magnetic resonance imaging (fMRI) data. The entire Autism Brain Imaging Data Exchange 1 (ABIDE 1) data set is utilized to investigate the performance of our proposed methods. First, we construct the brain networks from brain fMRI images and define the raw features based on such brain networks. Second, we employ an autoencoder (AE) to learn the advanced features from the raw features. Third, we train a deep neural network (DNN) with the advanced features, which achieves the classification accuracy of 76.2% and the receiving operating characteristic curve (AUC) of 79.7%. As a comparison, we also apply the same advanced features to train several traditional machine learning algorithms to benchmark the classification performance. Finally, we combine the DNN with the pretrained AE and train it with the raw features, which achieves the classification accuracy of 79.2% and the AUC of 82.4%. These results show that our proposed deep learning methods outperform the state-of-the-art methods.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,654
Score d'incertitude au seuil0,439

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,246
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle