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Enregistrement W3093567895 · doi:10.1101/2020.10.23.352898

N-myristoyltransferase: Tracing Steps Backwards to Find a Way Forward

2020· preprint· en· W3093567895 sur OpenAlexafffund
Dean Reddick, Daniel Ikenna Udenwobele, David Datzkiw, Revanti Mukherjee, Shailly Varma Shrivastav, Sara V. Good, Anuraag Shrivastav

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Kinase Regulation and GTPase Signaling
Établissements canadiensResearch Institute in Oncology and HematologyCancerCare ManitobaUniversity of Winnipeg
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCancerCare Manitoba Foundation
Mots-clésMyristoylationNLSNuclear localization sequenceBiologyGeneTranscription factorPhosphorylationGeneticsCell biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract N-myristoylation refers to the attachment of a 14-carbon fatty acid onto the N-terminal glycine residue of a target protein. The myristoylation reaction, catalyzed by N-myristoyltrasnferase (NMT), is essential for regulating cellular activities such as signal transduction, proliferation, migration, differentiation, and transformation. Although a considerable amount of research is performed on the overexpression of NMT in pathogenic conditions, a fundamental knowledge gap exists on the evolution of NMT and the functional impact of myristoylation for normal cellular development and functions. We performed evolutionary analyses of the NMT gene and found that most non-vertebrates harbor a single nmt gene and all vertebrates examined harbor two genes; nmt1 and nmt2. For the first time, we report that teleosts harbor two copies of nmt1, named nmt1a and nmt1b. We traced the evolutionary history of the chromosomal fragments hosting NMT1 and NMT2 in humans and found that NMT1 and NMT2 trace back to a single vertebrate ancestral chromosome. We also report the presence of putative nuclear localization sequence (NLS) and amino acid residues flanking NLS. The presence of phosphorylatable amino acid residues flanking the NLS suggests that nuclear localization of NMT is regulated by phosphorylation. The nuclear localization of NMT suggest its potential role in gene transcription.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,088
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,229
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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