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Enregistrement W3093790688 · doi:10.1101/2020.10.20.345868

A G protein-coupled receptor-like module regulates Cellulose Synthase secretion from the endomembrane system in Arabidopsis

2020· preprint· en· W3093790688 sur OpenAlexaff
Heather E. McFarlane, Daniela Mutwil‐Anderwald, Jana Verbančič, Kelsey L. Picard, Timothy E. Gookin, Anja Froehlich, Luisa M. Trindade, José M. Alonso, Sarah M. Assmann, Staffan Persson

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePolysaccharides and Plant Cell Walls
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEndomembrane systemCell biologyGolgi apparatusSecretionBiologyTransmembrane domainTransmembrane proteinTransport proteinGolgi membraneBiochemistryChemistryReceptorEndoplasmic reticulum

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Cellulose synthesis is essential for plant morphology, water transport and defense, and provides raw material for biomaterials and fuels. Cellulose is produced at the plasma membrane by Cellulose Synthase (CESA) protein complexes (CSCs). CSCs are assembled in the endomembrane system and then trafficked from the Golgi apparatus and trans -Golgi Network (TGN) to the plasma membrane. Since CESA enzymes are only active in the plasma membrane, control of CSC secretion is a critical step in the regulation of cellulose synthesis. However, the regulatory framework for CSC secretion is not clarified. In this study, we identify members of a family of seven transmembrane domain-containing proteins (7TMs) as important for cellulose production during cell wall integrity stress. 7TM proteins are often associated with guanine nucleotide-binding protein (G) protein signalling and mutants in several of the canonical G protein complex components phenocopied the 7tm mutant plants. Unexpectedly, the 7TM proteins localized to the Golgi apparatus/TGN where they interacted with the G protein complex. Here, the 7TMs and G proteins regulated CESA trafficking, but did not affect general protein secretion. Furthermore, during cell wall stress, 7TMs’ localization was biased towards small CESA-containing vesicles, specifically associated with CSC trafficking. Our results thus outline how a G protein-coupled module regulates CESA trafficking and reveal that defects in this process lead to exacerbated responses upon exposure to cell wall integrity stress.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,179
Écart entre enseignants0,165 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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