Detection of <scp>HPV16</scp>/18 <scp>E6</scp> Oncoproteins in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma Using a Protein Immunochromatographic Assay
Notice bibliographique
Résumé
Objectives/Hypothesis The accurate diagnostic assessment of clinically relevant human papillomavirus (HPV) infections in patients with head and neck squamous cell carcinoma represents an urgent unmet medical need. The aim of this study was to determine feasibility, accuracy, and clinical significance of HPV16/18 E6 oncoprotein detection on cytological specimens from oropharyngeal squamous cell carcinoma (OPSCC) and neck lymph node metastasis of SCC from unknown primary tumor (CUP) via a protein immunochromatographic assay. Study Design Cross‐sectional study. Methods Cytological specimens from primary tumor and neck metastases were collected from 34 patients with OPSCC or CUP and applied to a lateral flow format test that detects HPV16 and HPV18 E6 oncoproteins. E6 oncoprotein positivity or negativity in these specimens was compared to the specimens' “HPV‐driven” reference status, defined by presence of HPV‐DNA in combination with p16 INK4a overexpression and/or HPV E6 seropositivity. Results Eighteen of 29 OPSCC (62%) and three of five CUP (60%) were HPV‐driven according to our reference method. The E6 oncoprotein lateral flow test had a sensitivity of 94% (95% CI: 70%–100%) and a specificity of 100% (95% CI: 66%–100%) on primary tumor, and a sensitivity of 88% (95% CI: 64%–99%) and a specificity of 100% (95% CI: 74%–100%) on neck metastases. Test agreement between the E6 lateral flow test and the clinical reference method, HPV‐DNA plus p16 INK4a was excellent, both for primary lesion and neck metastases. Conclusions We found the detection of HPV16/18 E6 oncoproteins to be a feasible, highly reliable, and low‐invasive method to assess “HPV‐driven” status in OPSCC and CUP. Level of Evidence II Laryngoscope , 131:1042–1048, 2021
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».