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Enregistrement W3094120141 · doi:10.1002/lary.29184

Detection of <scp>HPV16</scp>/18 <scp>E6</scp> Oncoproteins in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma Using a Protein Immunochromatographic Assay

2020· article· en· W3094120141 sur OpenAlexaff
Anna Menegaldo, Lea Schroeder, Dana Holzinger, Giancarlo Tirelli, Elisa Dal Cin, Margherita Tofanelli, Stefania Rigo, Monica Mantovani, Marco Stellin, Annarosa Del Mistro, Angelo Paolo Dei Tos, Angela Guerriero, Monia Niero, Daniele Borsetto, Maria Cristina Da Mosto, Jerry Polesel, Michael Pawlita, Tim Waterboer, Paolo Boscolo‐Rizzo

Notice bibliographique

RevueThe Laryngoscope · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHead and Neck Cancer Studies
Établissements canadiensSt. Thomas Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineHead and neck squamous-cell carcinomaHead and neck cancerNegativity effectMetastasisCancerOncologyCarcinomaLymph nodeLymphPathologyClinical significanceInternal medicineCancer research

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Objectives/Hypothesis The accurate diagnostic assessment of clinically relevant human papillomavirus (HPV) infections in patients with head and neck squamous cell carcinoma represents an urgent unmet medical need. The aim of this study was to determine feasibility, accuracy, and clinical significance of HPV16/18 E6 oncoprotein detection on cytological specimens from oropharyngeal squamous cell carcinoma (OPSCC) and neck lymph node metastasis of SCC from unknown primary tumor (CUP) via a protein immunochromatographic assay. Study Design Cross‐sectional study. Methods Cytological specimens from primary tumor and neck metastases were collected from 34 patients with OPSCC or CUP and applied to a lateral flow format test that detects HPV16 and HPV18 E6 oncoproteins. E6 oncoprotein positivity or negativity in these specimens was compared to the specimens' “HPV‐driven” reference status, defined by presence of HPV‐DNA in combination with p16 INK4a overexpression and/or HPV E6 seropositivity. Results Eighteen of 29 OPSCC (62%) and three of five CUP (60%) were HPV‐driven according to our reference method. The E6 oncoprotein lateral flow test had a sensitivity of 94% (95% CI: 70%–100%) and a specificity of 100% (95% CI: 66%–100%) on primary tumor, and a sensitivity of 88% (95% CI: 64%–99%) and a specificity of 100% (95% CI: 74%–100%) on neck metastases. Test agreement between the E6 lateral flow test and the clinical reference method, HPV‐DNA plus p16 INK4a was excellent, both for primary lesion and neck metastases. Conclusions We found the detection of HPV16/18 E6 oncoproteins to be a feasible, highly reliable, and low‐invasive method to assess “HPV‐driven” status in OPSCC and CUP. Level of Evidence II Laryngoscope , 131:1042–1048, 2021

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,150
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,267
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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