Target identification of a novel unsymmetrical 1,3,4‐oxadiazole derivative with antiproliferative properties
Notice bibliographique
Résumé
1,3,4-Oxadiazole derivatives are widely used in research on antineoplastic drugs. Recently, we discovered a novel unsymmetrical 1,3,4-oxadiazole compound with antiproliferative properties called 2j. To further investigate its possible targets and molecular mechanisms, RNA-seq was performed and the differentially expressed genes (DEGs) were obtained after treatment. Data were analyzed using functional (Gene Ontology term) and pathway (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes) enrichment of the DEGs. The hub genes were determined by the analysis of protein-protein interaction networks. The connectivity map (CMap) information provided insight into the model action of antitumor small molecule drugs. Hub genes have been identified through function gene networks using STRING analysis. The small molecular targets obtained by CMap comparison showed that 2j is a tubulin inhibitor and it acts mainly affecting tumor cells through the cell cycle, FoxO signaling pathway, apoptotic, and p53 signaling pathways. The possible targets of 2j could be TUBA1A and TUBA4A. Molecular docking results indicated that 2j interacts at the colchicine-binding site on tubulin.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».