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Enregistrement W3094198797 · doi:10.3389/fonc.2020.574552

Isobaric Tags for Relative and Absolute Quantitation in Proteomic Analysis of Potential Biomarkers in Invasive Cancer, Ductal Carcinoma In Situ, and Mammary Fibroadenoma

2020· article· en· W3094198797 sur OpenAlexaff
Hao Wu, Xianyu Zhang, Ming Niu, Fei-Feng Li, Song Gao, Wei Wei, Siwei Li, Xing-Da Zhang, Shu‐Lin Liu, Da Pang

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Oncology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueAdvanced Proteomics Techniques and Applications
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésFibroadenomaDuctal carcinomaBreast cancerBreast FibroadenomaProteomicsMedicineMalignancyPathologyCancerOncologyCancer researchBiologyInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVES: Breast malignancy is a serious threat to women's health around the world. Following the rapid progress in the field of cancer diagnostics and identification of pathological markers, breast tumor treatment methods have been greatly improved. However, for invasive, ductal carcinomas and mammary fibroadenoma, there is an urgent demand for better breast tumor-linked biomarkers. The current study was designed to identify diagnostic and/or therapeutic protein biomarkers for breast tumors. METHODS: iTRAQ) proteomic analysis was employed to characterize differentially expressed proteins for potential biomarkers in IBC, DCIS, and fibroadenomas by comparisons with their matched adjacent tissues and/or normal breast tissues. The public databases Metascape and String were used for bioinformatic analyses. RESULTS: Using the proteomics approach, we identified differentially expressed proteins in tissues of different breast tumors compared to normal/adjacent breast tissues, including 100 in IBC, 52 in DCIS, and 44 in fibroadenoma. Among the 100 IBC differentially expressed proteins, 37 were found to be specific to this type of cancer only. Additionally, four proteins were specifically expressed in DCIS and four in fibroadenoma. Compared to corresponding adjacent tissues and normal breast tissues, 18 step-changing proteins were differentially expressed in IBC, 14 in DCIS, and 13 in fibroadenoma, respectively. Compared to DCIS and normal breast tissues, 65 proteins were differentially expressed in IBC with growing levels of malignancy. CONCLUSIONS: The identified potential protein biomarkers may be used as diagnostic and/or therapeutic targets in breast tumors.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,187
Score d'incertitude au seuil0,591

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,289
Écart entre enseignants0,274 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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