Sentinel surveillance of Lyme disease risk in Canada, 2019: Results from the first year of the Canadian Lyme Sentinel Network (CaLSeN)
Notice bibliographique
Résumé
Background: Lyme disease is an emerging vector-borne zoonotic disease of increasing public health importance in Canada.As part of its mandate, the Canadian Lyme Disease Research Network (CLyDRN) launched a pan-Canadian sentinel surveillance initiative, the Canadian Lyme Sentinel Network (CaLSeN), in 2019.Objectives: To create a standardized, national sentinel surveillance network providing a real-time portrait of the evolving environmental risk of Lyme disease in each province. Methods:A multicriteria decision analysis (MCDA) approach was used in the selection of sentinel regions.Within each sentinel region, a systematic drag sampling protocol was performed in selected sampling sites.Ticks collected during these active surveillance visits were identified to species, and Ixodes spp.ticks were tested for infection with Borrelia burgdorferi, Borrelia miyamotoi, Anaplasma phagocytophilum, Babesia microti and Powassan virus Results: In 2019, a total of 567 Ixodes spp.ticks (I.scapularis [n=550]; I. pacificus [n=10]; and I. angustus [n=7]) were collected in seven provinces: British Columbia, Manitoba, Ontario, Québec, New Brunswick, Nova Scotia and Prince Edward Island.The highest mean tick densities (nymphs/100 m 2 ) were found in sentinel regions of Lunenburg (0.45), Montréal (0.43) and Granby (0.38).Overall, the Borrelia burgdorferi prevalence in ticks was 25.2% (0%-45.0%).One I. angustus nymph from British Columbia was positive for Babesia microti, a first for the province.The deer tick lineage of Powassan virus was detected in one adult I. scapularis in Nova Scotia.Conclusion: CaLSeN provides the first coordinated national active surveillance initiative for tick-borne disease in Canada.Through multidisciplinary collaborations between experts in each province, the pilot year was successful in establishing a baseline for Lyme disease risk across the country, allowing future trends to be detected and studied.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».