MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W3094439767 · doi:10.1152/ajpregu.00215.2020

Use of a carbonic anhydrase Ca17a knockout to investigate mechanisms of ion uptake in zebrafish (<i>Danio rerio</i>)

2020· article· en· W3094439767 sur OpenAlexafffund
Alex M. Zimmer, Milica Mandic, Hong M. Yew, Emma Kunert, Yihang K. Pan, Jimmy Ha, Raymond W. M. Kwong, Kathleen M. Gilmour, Steve F. Perry

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Physiology-Regulatory, Integrative and Comparative Physiology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiquePhysiological and biochemical adaptations
Établissements canadiensUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésDanioZebrafishMutantCarbonic anhydraseGene knockdownBiologyCarbonic anhydrase IIChemistryBiochemistryCell biologyEnzymeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In fishes, branchial cytosolic carbonic anhydrase (CA) plays an important role in ion and acid-base regulation. The Ca17a isoform in zebrafish ( Danio rerio) is expressed abundantly in Na+-absorbing/H+-secreting H+-ATPase-rich (HR) cells. The present study aimed to identify the role of Ca17a in ion and acid-base regulation across life stages using CRISPR/Cas9 gene editing. However, in preliminary experiments, we established that ca17a knockout is lethal with ca17a−/− mutants exhibiting a significant decrease in survival beginning at ∼12 days postfertilization (dpf) and with no individuals surviving past 19 dpf. Based on these findings, we hypothesized that ca17a−/− mutants would display alterations in ion and acid-base balance and that these physiological disturbances might underlie their early demise. Na+ uptake rates were significantly increased by up to 300% in homozygous mutants compared with wild-type individuals at 4 and 9 dpf; however, whole body Na+ content remained constant. While Cl− uptake was significantly reduced in ca17a−/− mutants, Cl− content was unaffected. Reduction of CA activity by Ca17a morpholino knockdown or ethoxzolamide treatments similarly reduced Cl− uptake, implicating Ca17a in the mechanism of Cl− uptake by larval zebrafish. H+ secretion, O2 consumption, CO2 excretion, and ammonia excretion were generally unaltered in ca17a−/− mutants. In conclusion, while the loss of Ca17a caused marked changes in ion uptake rates, providing strong evidence for a Ca17a-dependent Cl− uptake mechanism, the underlying causes of the lethality of this mutation in zebrafish remain unclear.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,018

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,043
Tête enseignante GPT0,255
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueAmerican Journal of Physiology-Regulatory, Integrative and Comparative Physiology→Même sujetPhysiological and biochemical adaptations→Travaux en français237 207→