The contribution of extrachromosomal DNA to genome plasticity in malaria parasites
Notice bibliographique
Résumé
Malaria caused by the protozoan parasite Plasmodium falciparum continues to impose significant morbidity and mortality, despite substantial investment into drug and vaccine development and deployment. Underlying the resilience of this parasite is its remarkable ability to undergo genome modifications, thus, providing parasite populations with extensive genetic variability that accelerates selection of drug resistance and limits the efficacy of most vaccines. This genome plasticity is rooted in the mechanisms of DNA repair that parasites employ to maintain genome integrity, a process skewed toward homologous recombination through the evolutionary loss of classical nonhomologous end joining. Repair of DNA double-strand breaks have been shown to enable "shuffling" of antigen-encoding gene sequences to vastly increase antigen diversity and to enable copy number expansion of genes that contribute to drug resistance. The latter phenomenon has been proposed to be a major contributor to the rise of resistance to several classes of antimalarial drugs. In this issue of Molecular Microbiology, McDaniels and colleagues add yet another mechanism that malaria parasites use to reduce drug susceptibility by demonstrating that P. falciparum can maintain expanded arrays of drug resistance cassettes as stably replicating, circular, extrachromosomal DNAs, thus, expanding genome plasticity beyond the parasite's 14 nuclear chromosomes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».