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Enregistrement W3094988533 · doi:10.1038/s41598-020-75754-7

Masking terminal neo-epitopes of linear peptides through glycosylation favours immune responses towards core epitopes producing parental protein bound antibodies

2020· article· en· W3094988533 sur OpenAlexafffund
Robert A. Pon, Anne Marcil, Wangxue Chen, Christine Gadoury, Dean Williams, Kenneth Chan, Hongyan Zhou, Amalia Ponce, Komal Gurnani, Anindita Chattopadhyay, Wei Zou

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMonoclonal and Polyclonal Antibodies Research
Établissements canadiensNational Research Council Canada
Organismes subventionnairesNational Research Council CanadaHealth Canada
Mots-clésEpitopeLinear epitopeAntibodyImmunogenicityImmunogenPeptideGlycosylationBiologyChemistryMimotopePeptide sequenceMolecular biologyBiochemistryMonoclonal antibodyImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Glycosylation of hydrophobic peptides at one terminus effectively increases their water-solubility, and conjugation through the opposing end to a carrier protein, renders them more immunogenic. Moreover, the glycosylation minimizes antibody responses to potentially deleterious, non-productive terminal neo-epitope regions of the peptides, and consequently shifts peptide immunogenicity towards the core amino acid residues. As proof of concept, glycopeptide-protein conjugates related to influenza hemagglutinin (HA), neuraminidase (NA), and the dimerization loop region of human epidermal growth factor receptor 2 (Her2), demonstrated a favorable production of core peptide specific antibodies as determined by ELISA studies. Furthermore, glycosylated Her2 peptide conjugate antisera were also shown to recognize full length Her2 protein by ELISA and at the cell surface through flow cytometry analysis. In contrast, unmasked peptide conjugates generated significant antibody populations that were specific to the terminal neo-epitope of the peptide immunogen that are notably absent in parental proteins. Antibodies generated in this manner to peptides in the dimerization loop of Her2 are also functional as demonstrated by the growth inhibition of Her2 expressing SKBR3 carcinoma cells. This method provides a technique to tailor-make epitope-specific antibodies that may facilitate vaccine, therapeutic and diagnostic antibody development.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,074
Tête enseignante GPT0,348
Écart entre enseignants0,274 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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