MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3095173492 · doi:10.1101/2020.10.29.20222679

A Novel 3-Dimensional technique in measuring pericoronary epicardial adipose tissue radiodensity

2020· preprint· en· W3095173492 sur OpenAlexaff
Lingyu Xu, Stanislau Hrybouski, Yuancheng Xu, Richard Coulden, Emer Sonnex, D. Ian Paterson, Craig Butler

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiovascular Disease and Adiposity
Établissements canadiensWomen and Children’s Health Research InstituteUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésRadiodensityHounsfield scaleReproducibilitySegmentationMedicineAdipose tissueNuclear medicineRadiologyComputed tomographyComputer scienceMathematicsRadiographyArtificial intelligenceInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Objectives This study aimed to investigate a novel semi-automated three-dimensional (3D) quantification of the pericoronary epicardial adipose tissue radiodensity (PCATrd). Methods Twenty-four subjects who previously underwent contrast-enhanced cardiac CT scans were retrospectively identified. The PCATrd was measured in ITK-SNAP imaging software using a Hounsfield unit threshold (−190,-3) to define epicardial adipose tissue (EAT). A spherical 3D brush tool was used on multiplanar reformatted images to segment the PCAT. We defined the PCATrd as EAT within the orthogonal distance from the coronary artery (CA) outer wall equal to the diameter of the corresponding CA segment. The segmentation followed the path of major CAs. Additionally, the PCAT of twenty-five calcified segments were segmented. Reliability of this novel segmentation protocol was assessed using Dice Similarity Coefficients (DSCs) and intraclass coefficient (ICC). Results The segmentation reproducibility for the PCAT was high, with intraobserver DSC 0.86±0.04 for the full length of major CAs and 0.85±0.07 for the calcified segments, and interobserver DSC 0.84±0.04 for the full length of major CAs and 0.83±0.05 for the calcified segments. The reproducibility of the PCATrd value assessed by ICC was also excellent, with intraobserver ICC 0.99 for the full length of major CAs and 0.99 for the calcified segments, and interobserver ICC 0.99 for the full length of major CAs and 0.99 for the calcified segments. Conclusions Our novel 3D PCATrd quantification technique is reliable and reproducible. The availability of the open source software and detailed image analysis pipeline will enable reliable replications and broad uptake of our technique. Key points We have produced a novel, semiautomated technique to comprehensively quantify pericoronary epicardial adipose tissue radiodensity (PCATrd) which is a novel imaging biomarker of coronary inflammation. Our method of PCAT segmentation has excellent reproducibility. We use open source software and provide detailed image analysis pipeline of quantifying PCATrd, which will allow easy replication and broad uptake of our technique.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,785
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,267
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuemedRxivMême sujetCardiovascular Disease and AdiposityTravaux en français237 207