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Enregistrement W3095423013 · doi:10.1080/07060661.2020.1829065

DNA-barcoding identification of <i>Dothistroma septosporum</i> on <i>Pinus contorta</i> var. <i>latifolia, P. banksiana</i> and their hybrid in northern Alberta, Canada

2020· article· en· W3095423013 sur OpenAlexafffundvenueabout
Nicolas Feau, Tod D. Ramsfield, Colin L. Myrholm, Bradley Tomm, Herb F. Cerezke, Andy Benowicz, Erica Samis, Ashley Romano, Angela Dale, Arnaud Capron, Renate Heinzelmann, Richard C. Hamelin

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Plant Pathology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Pathogens and Fungal Diseases
Établissements canadiensFPInnovationsUniversité LavalNatural Resources CanadaAlberta Ministry of Agriculture and ForestryCanadian Forest ServiceUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesGenome Canada
Mots-clésPinus contortaBiologyBlightBotanyDNA barcodingAssortative matingEcologyMating

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The ascomycete fungi Dothistroma septosporum (Dorogin) M. Morelet and D. pini Hulbary are both responsible for Dothistroma needle blight disease (DNB) on pines. Using a DNA-barcoding approach, we confirmed that the DNB infection of lodgepole pine (Pinus contorta Dougl. var. latifolia Engelm.), jack pine (P. banksiana Lamb.) and their hybrid in four research sites in northern Alberta (Canada) was caused by D. septosporum, confirming that the range of D. septosporum extends east of the Rocky Mountains into Alberta. Analysis of mating-type (MAT) genes showed the presence of both mating types in each of the pine plantations, indicating that the pathogen has the potential to complete its lifecycle in this region. Controlled inoculation confirmed that the two native pines found in this area (P. contorta var. latifolia and P. banksiana) and their hybrid are susceptible to D. septosporum, suggesting that continuous monitoring of the disease needs to be carried out to prevent any future outbreak in natural stands.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,176
Score d'incertitude au seuil0,353

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,173
Écart entre enseignants0,167 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2020
Routes d'admission4
Résumé présentoui

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