Dynamics in the expression of epigenetic modifiers and histone modifications in perinatal rat germ cells during de novo DNA methylation†
Notice bibliographique
Résumé
Epigenetic reprogramming during perinatal germ cell development is essential for genomic imprinting and cell differentiation; however, the actors of this key event and their dynamics are poorly understood in rats. Our study aimed to characterize the expression patterns of epigenetic modifiers and the changes in histone modifications in rat gonocytes at the time of de novo DNA methylation. Using transgenic rats expressing Green Fluorescent Protein (GFP) specifically in germ cells, we purified male gonocytes by fluorescent activated cell sorting at various stages of perinatal development and established the transcriptomic profile of 165 epigenetic regulators. Using immunofluorescence on gonad sections, we tracked six histone modifications in rat male and female perinatal germ cells over time, including methylation of histone H3 on lysines 27, 9, and 4; ubiquitination of histone H2A on lysine119; and acetylation of histone H2B on lysine 20. The results revealed the dynamics in the expression of ten-eleven translocation enzymes and DNA methyltransferases in male gonocytes at the time of de novo DNA methylation. Moreover, our transcriptomic data indicate a decrease in histone ubiquitination and methylation coinciding with the beginning of de novo DNA methylation. Decreases in H2AK119Ub and H3K27me3 were further confirmed by immunofluorescence in the male germ cells but were not consistent for all H3 methylation sites examined. Together, our data highlighted transient chromatin remodeling involving histone modifications during de novo DNA methylation. Further studies addressing how these dynamic changes in histone posttranslational modifications could guide de novo DNA methylation will help explain the complex establishment of the male germ cell epigenome.
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».