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Enregistrement W3099450297 · doi:10.1101/378109

Autoimmunity to hypocretin and molecular mimicry to flu antigens in Type 1 narcolepsy

2018· preprint· en· W3099450297 sur OpenAlexaff
Guo Luo, Aditya Ambati, Ling Lin, Mélodie Bonvalet, Markku Partinen, Xuhuai Ji, Holden T. Maecker, Emmanuel Mignot

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2018
Typepreprint
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueSleep and Wakefulness Research
Établissements canadiensInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesNational Institutes of Health
Mots-clésNarcolepsyMolecular mimicryEpitopeAutoimmunityAntigenImmunologyImmunodominanceBiologyT-cell receptorImmune systemT cellVirology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Type 1 narcolepsy (T1N) is caused by hypocretin (HCRT) neuronal loss. Association with the Human Leukocyte Antigen (HLA)-DQB1*06:02/DQA1*01:02 (98% vs 25%) heterodimer (DQ0602), T cell receptor (TCR) and other immune loci suggest autoimmunity but autoantigen(s) are unknown. Onset is seasonal and associated with influenza A, notably pandemic 2009 H1N1 (pH1N1). An extensive unbiased DQ0602 binding peptide screen was performed encompassing peptides derived from Pandemrix ® X-179-A pH1N1 influenza-A vaccine, a known T1N trigger, other H1N1 strains, and potential human autoantigens HCRT and RFX4, identifying 109 binders. The presence of cognate tetramer-peptide specific CD4 + T cells was studied in 35 narcolepsy cases and 22 DQ0602 controls after expansion of antigen-specific cells in Peripheral Blood Monocytes Cell (PBMC) cultures. Higher reactivity to influenza epitopes pHA 273-287 (pH1N1 specific) and PR8 (H1N1 pre 2009)-specific NP 17-31 were observed in T1N. Extensive reactivity to C-amidated but not native version of HCRT 54-66 and HCRT 86-97 , which are two highly homologous peptides (HCRT NH2 ) was observed with higher frequencies of specific T cells in T1N. TCRα/β CDR3 sequences found in pHA 273-287, NP 17-31 and HCRT NH2 tetramer positive CD4 + cells were also retrieved in single INFγ-secreting CD4 + sorted cells stimulated with Pandemrix ® , confirming immunodominance and functional significance in DQ0602-mediated responses and molecular mimicry. TCRα/β CDR3 motifs of HCRT 54-66 and HCRT 86-97 tetramers were extensively shared. Particularly notable was sharing across subjects of an CDR3α, CAVETDSWGKLQF (in association with various CDR3β that used TRAJ24, a chain modulated by Single Nucleotide Polymorphism (SNPs) rs1154155 and rs1483979 associated with T1N. Sharing of CDR3β CASSQETQGRNYGYTF (in association with various CDR3α was also observed with HCRT NH2 and pHA 273-287 -tetramers across subjects. This segment uses TRBV4-2, a segment modulated by narcolepsy-associated SNP rs1008599. Higher HCRT NH2 positive CD4 + T cell numbers in T1N together with sharing of J24 CAVETDSWGKLQF in HCRT NH2 autoimmune responses, indicates causal DQ0602-mediated CD4 + autoreactivity to HCRT in T1N. Our results provide evidence for autoimmunity and molecular mimicry with flu antigens modulated by genetic components in the pathophysiology of T1N.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,274
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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