MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3099785644 · doi:10.1186/s12967-020-02579-3

Revealing oral microbiota composition and functionality associated with heavy cigarette smoking

2020· article· en· W3099785644 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueJournal of Translational Medicine · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineDentistry
ThématiqueOral microbiology and periodontitis research
Établissements canadiensMcGill UniversityChristie (Canada)
Organismes subventionnairesUniversity of Sharjah
Mots-clésFirmicutesPrevotellaFusobacteriumVeillonellaProteobacteriaBacteroidetesNicotineNicotine patchBiologyFusobacteriaMicrobiologyActinobacteriaPhysiologyMedicineBacteroidesBacteriaPathologyGeneticsStreptococcus16S ribosomal RNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Heavy tobacco smoking, a hallmark feature of lung cancer, is drastically predominant in Middle Eastern populations. The precise links between nicotine dependence and the functional contribution of the oral microbiota remain unknown in these populations. METHODS: We evaluated the composition and functional capabilities of oral microbiota with relation to cigarette smoking in 105 adults through shotgun metagenomics using buccal swabs. RESULTS: The oral microbiota composition in our study subjects was dominated by the phyla Firmicutes, Proteobacteria, Actinobacteria, and Bacteroidetes, in addition to the genera Prevotella and Veillonella, similar to previously described westernized cohorts. Furthermore, the smoker's oral microbiota represented a significant abundance of Veillonella dispar, Leptotrichia spp. and Prevotella pleuritidis when compared to non-smokers. Within the smoking groups, differential relative abundance testing unveiled relative abundance of Streptobacillus hongkongensis, Fusobacterium massiliense, Prevotella bivia in high nicotine dependent compared to low nicotine dependent profiles based on Fagerström Test for Nicotine Dependence. Functional profiling showed marked differences between smokers and non-smokers. Smokers exhibited an enrichment of Tricarballylate utilization and Lactate racemization when compared to the non-smokers. According to their nicotine dependence, enrichment of Xanthosine utilization, p-Aminobenzoyl-Glutamate utilization, and multidrug efflux pump in Campylobacter jejuni biosynthesis modules were detected in the high nicotine dependent group. CONCLUSIONS: These compositional and functional differences may provide critical insight on how variations in the oral microbiota could predispose to respiratory illnesses and smoke cessation relapse in cigarette smokers. In particular, the observed enrichment of Fusobacterium and Prevotella in the oral microbiota possibly suggests an intriguing linkage to gut and lung cancers.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,439
Score d'incertitude au seuil0,632

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,050
Tête enseignante GPT0,307
Écart entre enseignants0,257 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle