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Enregistrement W3101376013 · doi:10.1101/2020.11.10.376210

A novel membrane protein Hoka regulates septate junction organization and stem cell homeostasis in the <i>Drosophila</i> gut

2020· preprint· en· W3101376013 sur OpenAlexfundno aff
Yasushi Izumi, Kyoko Furuse, Mikio Furuse

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueInvertebrate Immune Response Mechanisms
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitute of GeneticsJapan Society for the Promotion of Science
Mots-clésMidgutSeptate junctionsGene knockdownCell biologyBiologyCytoplasmStem cellMembrane proteinGeneBiochemistryIntracellularBotanyMembraneGap junction

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Smooth septate junctions (sSJs) regulate the paracellular transport in the intestinal and renal system in arthropods. In Drosophila , the organization and physiological function of sSJs are regulated by at least three sSJ-specific membrane proteins: Ssk, Mesh, and Tsp2A. Here, we report a novel sSJ membrane protein Hoka, which has a single membrane-spanning segment with a short extracellular region having 13-amino acids, and a cytoplasmic region with three repeats of the Tyr-Thr-Pro-Ala motif. The larval midgut in hoka -mutants shows a defect in sSJ structure. Hoka forms a complex with Ssk, Mesh, and Tsp2A and is required for the correct localization of these proteins to sSJs. Knockdown of hoka in the adult midgut leads to intestinal barrier dysfunction, stem cell overproliferation, and epithelial tumors. In hoka -knockdown midguts, aPKC is up-regulated in the cytoplasm and the apical membrane of epithelial cells. The depletion of aPKC and yki in hoka -knockdown midguts results in reduced stem cell overproliferation. These findings indicate that Hoka cooperates with the sSJ-proteins Ssk, Mesh, and Tsp2A to organize sSJs, and is required for maintaining intestinal stem cell homeostasis through the regulation of aPKC and Yki activities in the Drosophila midgut. Summary statement Depletion of hoka , a gene encoding a novel septate junction protein, from the Drosophila midgut results in the disruption of septate junctions, intestinal barrier dysfunction, stem cell overproliferation, and epithelial tumors.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,186
Écart entre enseignants0,173 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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