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Enregistrement W3102133957 · doi:10.1002/cyto.b.21971

Flow cytometric method transfer: Recommendations for best practice

2020· article· en· W3102133957 sur OpenAlexaff
Maciej Cabanski, Teri Oldaker, Jennifer J. Stewart, Nithianandan Selliah, Steve Eck, Cherie Green, Virginia Litwin, Alessandra Vitaliti

Notice bibliographique

RevueCytometry Part B Clinical Cytometry · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSingle-cell and spatial transcriptomics
Établissements canadiensCaprion (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésReliability (semiconductor)Computer scienceContext (archaeology)Instrumentation (computer programming)Transfer (computing)Flow (mathematics)Reliability engineeringRisk analysis (engineering)EngineeringMedicineMathematicsBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

As with many aspects of the validation and monitoring of flow cytometric methods, the method transfer processes and acceptance criteria described for other technologies are not fully applicable. This is due to the complexity of the highly configurable instrumentation, the complexity of cellular measurands, the lack of qualified reference materials for most assays, and limited specimen stability. There are multiple reasons for initiating a method transfer, multiple regulatory settings, and multiple context of use. All of these factors influence the specific requirements for the method transfer. This recommendation paper describes the considerations and best practices for the transfer of flow cytometric methods and provides individual case studies as examples. In addition, the manuscript emphasizes the importance of appropriately conducting a method transfer on data reliability.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,139
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,241
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,861
Score d'incertitude au seuil0,735

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,1390,241
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0030,003
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,005
Bibliométrie0,0100,007
Études des sciences et des technologies0,0040,005
Communication savante0,0110,010
Science ouverte0,0130,006
Intégrité de la recherche0,0180,014
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0290,051

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,139
Tête enseignante GPT0,422
Écart entre enseignants0,282 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
DomaineMéthodes
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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