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Enregistrement W3103533795 · doi:10.1161/hypertensionaha.120.15690

Chromosome 2 Fragment Substitutions in Dahl Salt-Sensitive Rats and RNA Sequencing Identified <i>Enpep</i> and <i>Hs2st1</i> as Vascular Inflammatory Modulators

2020· article· en· W3103533795 sur OpenAlexafffund
Olga Berillo, Sofiane Ouerd, Noureddine Idris-Khodja, Asia Rehman, Chantal Richer, Daniel Sinnett, Anne E. Kwitek, Pierre Paradis, Ernesto L. Schiffrin

Notice bibliographique

RevueHypertension · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAdipose Tissue and Metabolism
Établissements canadiensMcGill UniversityJewish General HospitalCentre Hospitalier Universitaire Sainte-Justine
Organismes subventionnairesNational Heart, Lung, and Blood InstituteCanadian Institutes of Health ResearchLady Davis Institute for Medical ResearchNational Institutes of HealthGovernment of CanadaCompute Canada
Mots-clésInflammationProinflammatory cytokineCongenicBiologyEndocrinologyInternal medicineMolecular biologyGeneBlood pressureChromosomeImmunologyMedicineGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Chromosome 2 introgression from normotensive Brown Norway (BN) rats into hypertensive Dahl salt-sensitive (SS) background (SS-chromosome 2 BN /Mcwi; consomic S2 B ) reduced blood pressure and vascular inflammation under a normal-salt diet (NSD). We hypothesized that BN chromosome 2 contains anti-inflammatory genes that could reduce blood pressure and vascular inflammation in rats fed NSD or high-salt diet (HSD). Four- to 6-week old male SS and congenic rats containing the BN chromosome 2 distal portion (SS.BN-[ rs13453786-rs66377062 ]/Aek; S2 B a) and middle segment (SS.BN-[ rs106982173-rs65057186 ]/Aek; S2 B b) were fed NSD or HSD (4% NaCl) up to age 12 to 13 weeks. Systolic blood pressure determined by telemetry was higher in SS rats fed HSD versus NSD. Systolic blood pressure was lower in both congenic rats than in SS under NSD, but similar under HSD versus SS. Reactive oxygen species generation using dihydroethidium staining, expression of vascular cell adhesion molecule-1 and monocyte chemoattractant protein-1, and immune cell infiltration by immunofluorescence demonstrated that S2 B a rats present less inflammation under NSD and more under HSD versus SS rats. RNA sequencing and reverse transcription-quantitative PCR identified 2 differentially expressed genes encoded within BN chromosome 2 distal portion that could act as regulators of vascular inflammation. These were downregulated glutamyl aminopeptidase ( Enpep ) that was anti-inflammatory under NSD and upregulated heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1 ( Hs2st1 ) that was proinflammatory under HSD. In conclusion, 2 differentially expressed genes encoded within introgressed BN chromosome 2 distal fragment were identified: Enpep associated with reduced vascular inflammation under NSD, and Hs2st1 , associated with increased vascular inflammation under HSD.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,234
Score d'incertitude au seuil0,858

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,234
Écart entre enseignants0,209 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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