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Enregistrement W3104252249 · doi:10.1029/2020jg006012

Magnetotaxis as an Adaptation to Enable Bacterial Shuttling of Microbial Sulfur and Sulfur Cycling Across Aquatic Oxic‐Anoxic Interfaces

2020· article· en· W3104252249 sur OpenAlexaff
Jinhua Li, Peiyu Liu, Jian Wang, Andrew P. Roberts, Yongxin Pan

Notice bibliographique

RevueJournal of Geophysical Research Biogeosciences · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGeomagnetism and Paleomagnetism Studies
Établissements canadiensCanadian Light Source (Canada)University of Saskatchewan
Organismes subventionnairesAustralian Research CouncilNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésAnoxic watersMagnetotactic bacteriaGreigiteBiogeochemical cycleSulfurChemistryMagnetosomeBiomineralizationSulfideSulfur cycleSulfateEnvironmental chemistryChemical engineeringMagnetiteBiophysicsPyriteMineralogyBiologyPaleontology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Magnetotactic bacteria (MTB) widely inhabit the oxic‐anoxic interface (OAI) of sediments and water columns, with their motility guided by geomagnetic fields (a behavior known as magnetotaxis). Beside biomineralizing membrane‐enveloped magnetite or greigite nanocrystals called magnetosomes, cells of many MTB groups contain numerous sulfur globules within their cells. Here, by combining transmission electron microscopy and synchrotron‐based scanning transmission X‐ray microscopy, we investigated the cellular structure and chemistry of Candidatus Magnetobacterium casensis (Mcas), a giant rod‐shaped MTB from the Nitrospirae phylum. We find that nitrate‐storing vacuoles and linearly polymeric sulfur globules occur exclusively within some Mcas cells along with magnetosomal magnetite. Genomic prediction indicates that Mcas cells have the potential to oxidize sulfide to sulfate (i.e., S 2− → S 0 → SO 3 2− → SO 4 2− ), to reduce sulfate to sulfide (i.e., SO 4 2− → SO 3 2− → S 2− ), and to reduce nitrate to NH 4 + /N 2 . Together with previous environmental observations, comparative genomic analysis allows us to propose a model for Mcas involving the microbial sulfur cycle across aquatic OAIs based on magnetotaxis. Via directional movement guided by geomagnetic fields, Mcas cells shuttle either upward to upper microoxic zones for sulfur oxidation and nitrate accumulation in the OAI, or downward to deeper anoxic zones for sulfur deposition by coupling sulfide oxidation and nitrate reduction. Development of magnetotaxis makes MTB an efficient bacterial shuttle for C, N, S, and Fe across aquatic OAI environments and likely contributes significantly to their global biogeochemical cycling. It also benefits cell growth and magnetosomal magnetite formation in MTB.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,046
Score d'incertitude au seuil0,533

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,044
Tête enseignante GPT0,336
Écart entre enseignants0,292 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations54
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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