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Enregistrement W3105389930 · doi:10.12688/wellcomeopenres.16378.2

Fostering global data sharing: highlighting the recommendations of the Research Data Alliance COVID-19 working group

2021· preprint· en· W3105389930 sur OpenAlexafffund
Claire C. Austin, Alexander Bernier, Louise Bezuidenhout, Juan Bicarregui, Timea Biro, Anne Cambon‐Thomsen, Stephanie Russo Carroll, Zoe Cournia, Piotr Wojciech Dąbrowski, Gayo Diallo, Thomas Duflot, Leyla Jael Castro, Sandra Gesing, Alejandra González-Beltrán, Anupama E. Gururaj, Natalie Harrower, Dawei Lin, Cláudia Bauzer Medeiros, Eva Méndez, Natalie Meyers, Daniel Mietchen, Rajini Nagrani, Gustav Nilsonne, Simon Parker, Brian Pickering, Amy Pienta, Panayiota Polydoratou, Fotis Psomopoulos, Stéphanie Rennes, Robyn Rowe, Susanna‐Assunta Sansone, Hugh Shanahan, Lina Sitz, Joanne Stocks, Marcos Roberto Tovani‐Palone, Mary Uhlmansiek

Notice bibliographique

RevueWellcome Open Research · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCOVID-19 diagnosis using AI
Établissements canadiensMcGill UniversityLaurentian UniversityEnvironment and Climate Change Canada
Organismes subventionnairesBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilUniversité de BordeauxHorizon 2020Rural Development AdministrationEuropean CommissionAgence Universitaire de la FrancophonieWellcome TrustFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São PauloNational Institute on Drug AbuseUniversity of MichiganNational Science Foundation
Mots-clésData sharingPreparednessInteroperabilityMedical researchMetadataKnowledge managementPolitical sciencePublic relationsData scienceMedicineComputer scienceWorld Wide WebAlternative medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The systemic challenges of the COVID-19 pandemic require cross-disciplinary collaboration in a global and timely fashion. Such collaboration needs open research practices and the sharing of research outputs, such as data and code, thereby facilitating research and research reproducibility and timely collaboration beyond borders. The Research Data Alliance COVID-19 Working Group recently published a set of recommendations and guidelines on data sharing and related best practices for COVID-19 research. These guidelines include recommendations for clinicians, researchers, policy- and decision-makers, funders, publishers, public health experts, disaster preparedness and response experts, infrastructure providers from the perspective of different domains (Clinical Medicine, Omics, Epidemiology, Social Sciences, Community Participation, Indigenous Peoples, Research Software, Legal and Ethical Considerations), and other potential users. These guidelines include recommendations for researchers, policymakers, funders, publishers and infrastructure providers from the perspective of different domains (Clinical Medicine, Omics, Epidemiology, Social Sciences, Community Participation, Indigenous Peoples, Research Software, Legal and Ethical Considerations). Several overarching themes have emerged from this document such as the need to balance the creation of data adherent to FAIR principles (findable, accessible, interoperable and reusable), with the need for quick data release; the use of trustworthy research data repositories; the use of well-annotated data with meaningful metadata; and practices of documenting methods and software. The resulting document marks an unprecedented cross-disciplinary, cross-sectoral, and cross-jurisdictional effort authored by over 160 experts from around the globe. This letter summarises key points of the Recommendations and Guidelines, highlights the relevant findings, shines a spotlight on the process, and suggests how these developments can be leveraged by the wider scientific community.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Étiquettes directes de modèles (non validées)

Étiquettes de catégorie et de devis d'étude par modèle, issues des rondes d'étiquetage. C'est une sortie machine, non validée, et le désaccord entre modèles est livré comme donnée. Aucun devis ici n'est encore validé contre MEDLINE.

BrasCatégoriesDevis d'étudeConfiance
gemmaScience ouverte
Domaine: non disponible · Genre: Empirique
Porte sur le système de recherche canadien: non · Porte sur un sujet canadien: non
Sans objetlow
gptMétarechercheScience ouverteCommunication savante
Domaine: Reproductibilité · Genre: Commentaire
Porte sur le système de recherche canadien: non · Porte sur un sujet canadien: non
Sans objetlow
modèles en désaccordL'accord compare des ensembles de catégories et des devis identiques entre les bras.

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,537
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,491
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Science ouverte
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,984
Score d'incertitude au seuil0,571

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,5370,491
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0030,004
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,006
Bibliométrie0,0100,011
Études des sciences et des technologies0,0150,044
Communication savante0,0650,083
Science ouverte0,0160,056
Intégrité de la recherche0,0450,075
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0070,008

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,803
Tête enseignante GPT0,591
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Étiqueté directement par 2 modèles lisant le dossier complet.

Science ouverteMétarechercheCommunication savante

Les modèles divergent sur des parties de cette classification; chaque voix est préservée dans la section en fin de page.

Devis d'étudeSans objet
DomaineReproductibilité
GenreEmpirique · Commentaire

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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