Phosphorylation-Dependent Conformations of the Disordered Carboxyl-Terminus Domain in the Epidermal Growth Factor Receptor
Notice bibliographique
Résumé
The epidermal growth factor receptor (EGFR), a receptor tyrosine kinase, regulates basic cellular functions and is a major target for anticancer therapeutics. The carboxyl-terminus domain is a disordered region of EGFR that contains the tyrosine residues, which undergo autophosphorylation followed by docking of signaling proteins. Local phosphorylation-dependent secondary structure has been identified and is thought to be associated with the signaling cascade. Deciphering and distinguishing the overall conformations, however, have been challenging because of the disordered nature of the carboxyl-terminus domain and resultant lack of well-defined three-dimensional structure for most of the domain. We investigated the overall conformational states of the isolated EGFR carboxyl-terminus domain using single-molecule Förster resonance energy transfer and coarse-grained simulations. Our results suggest that electrostatic interactions between charged residues emerge within the disordered domain upon phosphorylation, producing a looplike conformation. This conformation may enable binding of downstream signaling proteins and potentially reflect a general mechanism in which electrostatics transiently generate functional architectures in disordered regions of a well-folded protein.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».