MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3106605174 · doi:10.1080/03630269.2020.1850473

Twelve Cases of Hb Manitoba [α102(G9)Ser→Arg]: the Fluctuation in the Variant Expression

2020· article· en· W3106605174 sur OpenAlexaboutno aff
Mohamed S.M. Khalil, Adele Timbs, Shirley Henderson, Anna Schuh, John Old

Notice bibliographique

RevueHemoglobin · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHemoglobinopathies and Related Disorders
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHemoglobinHemoglobin variantsMolecular biologyChemistryGeneticsMedicineBiologyInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Hb Manitoba [α102(G9)Ser→Arg] is a rare α chain variant with diverse ethnic origins. It is mildly unstable with an expression of around 10.0–14.2% in the heterozygous state in most literature. In this study, 12 cases of Hb Manitoba [11 cases carried Hb Manitoba II (HBA1: c.309C>A) and one case carried Hb Manitoba IV (HBA1: c.307A>C)] were detected during a wide-spectrum study of α chain variants in the UK. Fluctuation in variant expression from 6.9 to 15.2% of total Hb on high performance liquid chromatography (HPLC) would pose a diagnostic dilemma in routine laboratories. Focusing on the variant expression, the median of Hb Manitoba was around 11.5% of total Hb in three cases, apparently with normal hemoglobin (Hb), and normal red blood cell (RBC) indices. Two cases showed a higher expression (13.9 and 15.2%) and five cases showed a lower expression (6.9–9.9%). The common α-thalassemia (α-thal) –α3.7 (rightward) deletion coexisted with one case of increased Hb Manitoba expression. Iron (or other nutrient) deficiency was likely the cause of decreased Hb Manitoba percentage in this study. The α73(EF2)Val→Val (α2) (HBA2: c.222G>T) polymorphism is published for the first time and coexisted with two cases. The Cap +14 (C>G) (HBA2: c.-24C>G) polymorphism coexisted with another case in a heterozygous state. In conclusion, the fluctuation in variant expression can cause a diagnostic dilemma, especially in routine laboratories. Screening for the common –α3.7 deletion and iron deficiency is recommended when an α chain variant is suspected.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Étude de cas · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil0,023

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,253
Écart entre enseignants0,228 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeÉtude de cas
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueHemoglobinMême sujetHemoglobinopathies and Related DisordersTravaux en français237 207