An unexpected donor in the adaptive introgression candidate <i>Helianthus annuus</i> subsp. <i>texanus</i>
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Hybridization is widely acknowledged as an important mechanism of acquiring adaptive variation. In Texas, the sunflower Helianthus annuus subsp. texanus is thought to have acquired herbivore resistance and morphological traits via introgression from a local congener, H. debilis . Here we test this hypothesis using whole genome sequencing data from across the entire range of H. annuus and possible donor species, as well as phenotypic data from a common garden study. We find that although it is morphologically convergent with H. debilis, H. a. texanus has conflicting signals of introgression. Genome wide tests (Patterson’s D and TreeMix) only find evidence of introgression from H. argophyllus (sister species to H. annuus and also sympatric), but not H. debilis , with the exception of one individual of 109 analysed. We further scanned the genome for localized signals of introgression using PCAdmix and found minimal but non-zero introgression from H. debilis and significant introgression from H. argophyllus . Putative introgressions mainly occur in high recombination regions as predicted by theory if introgressed ancestry contains maladaptive alleles. To reconcile the disparate findings of our analyses, we discuss potential test-specific confounding features, including introgression from other taxa. Given the paucity of introgression from H. debilis , we argue that the morphological convergence observed in Texas is likely independent of introgression.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».