Abstract PO-040: The role of mTOR in epigenetic regulation in cancer
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Changes in gene expression, including those caused by epigenetic dysregulation, represent a hallmark of cancer. The mechanistic/mammalian Target of Rapamycin (mTOR) is a serine/threonine kinase that coordinates nutrient availability to the regulation of cell growth and metabolism, which is frequently perturbed in cancer. mTOR exists in two structurally and functionally divergent complexes, mTOR complex 1 and 2 (mTORC1 and 2). mTORC1 regulates many metabolic pathways, including the serine-glycine-one carbon network (SGOC), a pathway modulating the production of S-adenosyl methionine (SAM) and α-ketoglutarate (α-KG). The latter two metabolites constitute essential co-substrates of histone methyltransferases and demethylases, respectively. However, how mTOR signaling controls epigenetic dynamics remains largely unknown. To address this important gap in knowledge, we treated two breast cancer cell lines (MCF7 and T47D) with allosteric (rapamycin) and active-site (INK128) mTOR inhibitors to study how mTOR may influence global histone methylation. We found that mTOR inhibitors significantly increased histone 3 lysine 9 tri-methylation (H3K9me3) and histone 3 lysine 27 tri-methylation (H3K27me3) but not histone 3 lysine 4 tri-methylation (H3K4me3) suggesting this effect was selective. Metabolomic tools were employed to decipher changes of epigenetic metabolites α-KG, SAM, S-Adenosyl homocysteine (SAH), methionine, and serine upon mTOR inhibition. These findings provide bases for my future work which will focus on establishing the role of alterations in mTOR signaling on epigenetic programs which drive tumorigenesis. A better understanding of this network may help identify new therapeutic targets to improve current cancer treatments. Citation Format: HaEun Kim, David Papadopoli, Ivan Topisirovic. The role of mTOR in epigenetic regulation in cancer [abstract]. In: Abstracts: AACR Special Virtual Conference on Epigenetics and Metabolism; October 15-16, 2020; 2020 Oct 15-16. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2020;80(23 Suppl):Abstract nr PO-040.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».