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Enregistrement W3108677307 · doi:10.3899/jrheum.200951

Metaanalysis Reveals Genetic Correlates of Osteoporosis Pathogenesis

2020· review· en· W3108677307 sur OpenAlexvenueno aff
Laith K. Hasan, Jihad Aljabban, Michael Rohr, Mohamed Mukhtar, Nikhil Adapa, Rahaf Salim, Nabeal Aljabban, Saad Syed, Sharjeel Syed, Maryam Panahiazar, Dexter Hadley, Wael N. Jarjour

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Rheumatology · 2020
Typereview
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueBiomarkers in Disease Mechanisms
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesU.S. National Library of MedicineNational Cancer Institute
Mots-clésMedicineOsteoporosisWnt signaling pathwayBioinformaticsSignal transductionInternal medicineBiologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Objective. Osteoporosis is a growing healthcare burden. By identifying osteoporosis-promoting genetic variations, we can spotlight targets for new pharmacologic therapies that will improve patient outcomes. In this metaanalysis, we analyzed mesenchymal stem cell (MSC) biomarkers in patients with osteoporosis. Methods. We employed our Search Tag Analyze Resource for the Gene Expression Omnibus (STARGEO) platform to conduct a metaanalysis to define osteoporosis pathogenesis. We compared 15 osteoporotic and 14 healthy control MSC samples. We then analyzed the genetic signature in Ingenuity Pathway Analysis. Results. The top canonical pathways identified that were statistically significant included the serine peptidase inhibitor kazal type 1 pancreatic cancer pathway, calcium signaling, pancreatic adenocarcinoma signaling, axonal guidance signaling, and glutamate receptor signaling. Upstream regulators involved in this disease process included ESR1 , dexamethasone, CTNNβ1, CREB1 , and ERBB2 . Conclusion. Although there has been extensive research looking at the genetic basis for inflammatory arthritis, very little literature currently exists that has identified genetic pathways contributing to osteoporosis. Our study has identified several important genes involved in osteoporosis pathogenesis including ESR1, CTNNβ1, CREB1 , and ERBB2. ESR1 has been shown to have numerous polymorphisms, which may play a prominent role in osteoporosis. The Wnt pathway, which includes the CTNNβ1 gene identified in our study, plays a prominent role in bone mass regulation. Wnt pathway polymorphisms can increase susceptibility to osteoporosis. Our analysis also suggests a potential mechanism for ERBB2 in osteoporosis through Semaphorin 4D ( SEMA4D ). Our metaanalysis identifies several genes and pathways that can be targeted to develop new anabolic drugs for osteoporosis treatment.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,954
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0050,002
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0020,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,267
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeAutre devis
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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