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Enregistrement W3111014536 · doi:10.1002/alz.040586

Accounting for systematic spatiotemporal variation improves connectome‐based models of tau spreading in human Alzheimer’s disease

2020· article· en· W3111014536 sur OpenAlexaff
Jacob W. Vogel, Alexandra L. Young, Neil P. Oxtoby, Ruben Smith, Rik Ossenkoppele, Leon Aksman, Olof Strandberg, Renaud La Joie, Michel J. Grothe, Gil D. Rabinovici, Daniel C. Alexander, Alan C. Evans, Oskar Hansson

Notice bibliographique

RevueAlzheimer s & Dementia · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAdvanced Neuroimaging Techniques and Applications
Établissements canadiensMcGill UniversityMontreal Neurological Institute and Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésConnectomeEntorhinal cortexContext (archaeology)Human Connectome ProjectNeuroscienceTractographyInferenceComputer scienceDiffusion MRIBiologyPsychologyArtificial intelligenceHippocampusFunctional connectivityMedicineMagnetic resonance imaging

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Studies in cells, animals and humans have each provided evidence that, in an Alzheimer’s disease (AD) context, tau may be spreading through the brain transneuronally. This information may be useful for modeling the spread of tau in humans. However, such models are confounded by the substantial heterogeneity in spreading patterns observed in AD. In this talk, I will discuss i) application of an epidemic spreading model (ESM) to tau‐PET data to model the spread of tau through the human connectome; ii) application of a spatiotemporal subtyping algorithm to identify separable tau‐spreading patterns; 3) how accounting for these heterogeneous patterns can improve connectome‐based models. Method The ESM simulates diffusion of an agent through a system of connected brain regions measured with diffusion tractography. We compare simulations across 312 individuals to observed tau‐PET data. We next use the Subtype and Staging Inference (SuStaIn), an algorithm combining disease progression models with clustering, to identify spatiotemporal subtypes of tau spreading across 1143 individuals. We describe demographic, cognitive and genetic associations with each subtype, and evaluate their stability over time and across different radiotracers. Finally, we apply the ESM separately to each AD subtype to assess whether overall model accuracy is improved by accounting for individual subtype. Result The best‐fitting ESM used the entorhinal cortex as the model epicenter, and explained 70% of the variance in the overall tau‐PET pattern across subjects. SuStaIn identified four spatiotemporal subtypes with differing tau‐PET patterns and phenotypic profiles: Limbic‐predominant, limbic‐sparing, posterior, and lateral‐temporal. These same four subtypes were observed in a separate cohort using a different radiotracer (similarity 0.7‐0.9). 86% of subjects exhibited the same subtype at follow‐up. The ESM selected a different epicenter for each subtype, and accounting for subtype‐specific variation resulted in a 17% improvement in model performance. Conclusion Connectome‐based models explain the majority of spatial variation in tau‐PET patterns. However, a one‐size‐fits‐all approach fails to account for heterogeneity of tau‐spreading patterns. Four stable phenotypes were observed, which may be characterized by vulnerability of different cortico‐limbic networks. Accounting for this heterogeneity will be necessary for any predictive modeling of tau spreading moving forward.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,009
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,036
Score d'incertitude au seuil0,071

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,009
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,115
Tête enseignante GPT0,357
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission1
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