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Enregistrement W3111592258 · doi:10.1093/neuonc/noaa222.015

ATRT-16. MODELLING ATRT THROUGH SWI/SNF COMPLEX DEFICIENCY IN GENETICALLY-ENGINEERED MOUSE MODELS

2020· article· en· W3111592258 sur OpenAlexaff
Andrew Bondoc, Brian Golbourn, Christian A. Smith, Annie Huang, James T. Rutka

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueChromatin Remodeling and Cancer
Établissements canadiensSickKids FoundationHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSMARCB1Atypical teratoid rhabdoid tumorBiologyEmbryonic stem cellStem cellCancer researchProgenitor cellNeural stem cellCell biologyGeneticsMedulloblastomaGeneGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Atypical Teratoid/Rhabdoid Tumours (ATRT) are highly malignant neoplasms arising primarily in the CNS of children. They are defined by loss of function mutations in smarcb1, a gene serving a vital role in neurogenesis and differentiation. In order to recapitulate ATRT in the mouse, we used a Cre-Lox recombination system to conditionally knockout smarcb1 in specific cell compartments. Loss of smarcb1 in BLBP-expressing cells of the developing brain led to severe neurologic defects. Mice exhibited seizures, ataxia, and median 12-day survival. Histological analysis revealed severe thinning of the cerebral cortex and cerebellum. Temporally-targeted smarcb1 loss in BLBP/Nestin-expressing embryonic compartments did not result in tumour formation. Similarly, BLBP-expressing, smarcb1-deficient neural stem/progenitor cells (NSC/NPCs) were isolated and allografted but did not form tumours. These cells demonstrated decreased proliferation, higher apoptosis, and upregulation of p53, CDKN1A, and CDKN2A. In contrast, ubiquitous smarcb1 loss at the earlier embryonic day 6.5 produced widespread tumorigenicity in the forebrain, hindbrain, skullbase, and spine; each with unique phenotypes, survival, and morphology. We employed a clinically-relevant Nanostring gene-panel screen to stratify tumours into genetically distinct subgroups. Our findings indicate that smarcb1 plays an important role in CNS development. Loss of smarcb1 in NSC/NPCs is lethal, and its developmental context influences cell fate. Targeted smarcb1 loss likely plays a tumorigenic role at an earlier developmental stage than previously determined, in a diverse array of primitive stem cells. These data support the generation of a murine ATRT model capable of producing distinct tumour entities that recapitulate the human disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,464
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,059
Tête enseignante GPT0,289
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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