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Enregistrement W3111753833 · doi:10.1093/neuonc/noaa222.088

DIPG-41. DISSECTING THE MECHANISTIC BASIS FOR <i>ACVR1</i> AND <i>PIK3CA</i> MUTATION CO-OCCURRENCE IN DIFFUSE MIDLINE GLIOMAS USING GENETICALLY ENGINEERED MOUSE MODELS

2020· article· en· W3111753833 sur OpenAlexaff
Annette Wu, Tak W. Mak, Jérôme Fortin

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGlioma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreUniversity Health Network
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésOLIG2BiologyForebrainGeneCarcinogenesisEpigeneticsTranscription factorCancer researchHistoneTranscriptomeMutationOligodendrocyteGeneticsNeuroscienceGene expressionMyelinCentral nervous system

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Diffuse midline gliomas (DMGs) are aggressive childhood brain tumors with a dismal prognosis. Most of these tumors carry K27M mutations in histone H3-encoding genes, particularly H3F3A and HIST1H3B. In addition, activating mutations in ACVR1 and PIK3CA co-occur in a subset of DMGs. To understand how these lesions drive the development of DMGs, we generated genetically engineered mouse models in which Acvr1G328V, Hist1h3bK27M, and Pik3caH1047R are targeted to the OLIG2-expressing cell lineage. Animals carrying Acvr1G328V and Pik3caH1047R, with (“AHPO”) or without (“APO”) Hist1h3bK27M, developed high-grade diffuse gliomas involving midline and forebrain regions. Neither Acvr1G328V nor Pik3caH1047R drove tumorigenesis by themselves, but Acvr1G328V was sufficient to cause oligodendroglial differentiation arrest, pointing to a role in the earliest stages of gliomas formation. Transcriptomic analyses of AHPO and APO tumors indicated a predominantly proneural and oligodendrocyte precursor-like gene expression signature, consistent with the corresponding human pathology. Genes encoding transcription factors (TFs) with dual roles in controlling glial and neuronal differentiation were upregulated in tumors. Some of these genes were mildly induced by Acvr1G328V alone. Functional experiments using CRISPR/Cas9-mediated gene editing in patient-derived cell lines confirmed a role for some of these TFs in controlling DMG cell fitness. Overall, our results suggest that Pik3caH1047R consolidates Acvr1G328V-induced glial differentiation arrest to drive DMG development and progression.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,019

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,050
Tête enseignante GPT0,312
Écart entre enseignants0,262 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
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