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Enregistrement W3111800502 · doi:10.1021/acs.biochem.0c00882

Further Investigation into the Biochemical Effects of Phosphorylation of Tropomyosin Tpm1.1(α). Serine-283 Is in Communication with the Midregion

2020· article· en· W3111800502 sur OpenAlexafffund
A. Madhushika M. Silva, Charitha L. Goonasekara, Michael Hayley, David H. Heeley

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiomyopathy and Myosin Studies
Établissements canadiensMemorial University of Newfoundland
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésPhosphorylationTropomyosinActinChemistrySerineMyosinBiophysicsBiochemistryPiBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The phosphorylated and unphosphorylated forms of tropomyosin Tpm1.1(α) are prepared from adult rabbit heart and compared biochemically. Electrophoresis confirms the high level of enrichment of the chromatography fractions and is consistent with a single site of phosphorylation. Covalently bound phosphate groups at position 283 of Tpm1.1(α) increase the rate of digestion at Leu-169, suggestive of a conformational rearrangement that extends to the midregion. Such a rearrangement, which is supported by ellipticity measurements between 25 and 42 °C, is consistent with a phosphorylation-mediated tightening of the interaction between various myofilament components. In a nonradioactive, co-sedimentation assay [30 mM KCl, 1 mM Mg(II), and 4 °C], phosphorylated Tpm1.1(α) displays a higher affinity for F-actin compared to that of the unphosphorylated control ( K d, 0.16 μM vs 0.26 μM). Phosphorylation decreases the concentration of thin filaments (pCa 4 plus ATP) required to attain a half-maximal rate of release of product from a pre-power stroke complex [myosin-S1-2-deoxy-3- O -( N -methylanthraniloyl)ADP-P i ], as investigated by double-mixing stopped-flow fluorescence, suggestive of a change in the proportion of active (turned on) and inactive (turned off) conformers, but similar maximum rates of product release are observed with either type of reconstituted thin filament. Phosphorylated thin filaments (pCa 4 and 8) display a higher affinity for myosin-S1(ADP) versus the control scenario without affecting isotherm steepness. Specific activities of ATP and Tpm1.1(α) are determined during an in vitro incubation of rat cardiac tissue [12 day-old, 50% phosphorylated Tpm1.1(α)] with [ 32 P]orthophosphate. The incorporation of an isotope into tropomyosin lags behind that of ATP by a factor of approximately 10, indicating that transfer is a comparatively slow process.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,222
Écart entre enseignants0,214 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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