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Enregistrement W3112674796 · doi:10.1002/alz.045461

Rationally designed antibodies selective for pathogenic tau aggregates

2020· article· en· W3112674796 sur OpenAlexaff
Andrei Roman, Shawn C. C. Hsueh, Johanne Kaplan, Ebrima Gibbs, Adekunle Aina, Steven S. Plotkin, Neil R. Cashman

Notice bibliographique

RevueAlzheimer s & Dementia · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAlzheimer's disease research and treatments
Établissements canadiensAmorfix (Canada)University of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEpitopeThioflavinMonoclonal antibodyTau proteinChemistryFörster resonance energy transferAntibodyPeptideProtein aggregationBiochemistryBiophysicsMolecular biologyAlzheimer's diseaseFluorescenceBiologyImmunologyDiseaseMedicinePathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Tauopathies are neurodegenerative disorders characterized by the abnormal aggregation of tau protein in the brain. Soluble toxic tau aggregates have the ability to transfer from cell‐to‐cell and to induce newly formed aggregates in recipient cells, thereby propagating tau pathology across the brain in a prion‐like manner. We used computational modeling to identify conformational “disease‐specific” epitopes predicted to become exposed on misfolded tau aggregates. Selectivity of antibodies for tau pathogenic species, as opposed to pan‐tau reactivity, is needed both in order to preserve normal tau function and to minimize the diversion of active antibody from the target through unproductive binding to more abundant non‐toxic forms of the protein. Method The ability of predicted disease‐associated conformational peptide epitopes to induce tau aggregation on their own was tested in a Thioflavin‐T fluorescence(ThT)‐based seeding assay. Mouse monoclonal antibodies raised against selected epitopes were screened by surface plasmon resonance (SPR) for binding to synthetic tau monomers, toxic oligomers, and soluble pre‐formed fibrils (PFFs). Recognition of naturally occurring tau species in Alzheimer’s disease (AD) brain was also confirmed by SPR. The ability of selected antibodies to inhibit induction of tau aggregation by AD brain seeds was assessed in a seeding assay using TauRD P301S FRET Biosensor Cells expressing tau constructs with different fluorescent labels producing a FRET signal when aggregated. Result Predicted conformational peptide epitopes capable of seeding activity in the ThT assay were used to immunize mice. SPR screening of hybridoma supernatants was used to identify antibody clones with the desired profile of preferential binding to a preparation of toxic tau oligomers vs non‐toxic tau monomers. A majority of these antibodies also bound soluble tau PFFs, a species believed to play a role in propagation of disease. Antibodies selected for further testing were found to recognize tau from AD brain extract by SPR and to inhibit seeding activity in a FRET assay. Conclusion Computational modeling for identification of predicted disease‐associated epitopes together with in vitro screening methods allowed for the generation of monoclonal antibodies with selectivity and activity against pathogenic, aggregated species of tau.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,045
Tête enseignante GPT0,314
Écart entre enseignants0,269 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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