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Enregistrement W3112934313 · doi:10.1038/s41591-021-01406-6

Gut microbiota signatures are associated with toxicity to combined CTLA-4 and PD-1 blockade

2021· article· en· W3112934313 sur OpenAlexafffund
Miles C. Andrews, Connie P.M. Duong, Vancheswaran Gopalakrishnan, Valerio Iebba, Wei-Shen Chen, Lisa Derosa, M.A. Wadud Khan, Alexandria P. Cogdill, Michael G. White, Matthew C. Wong, Gladys Ferrere, Aurélie Fluckiger, María Paula Roberti, Paule Opolon, Maryam Tidjani Alou, Satoru Yonekura, Whijae Roh, Christine N. Spencer, Irina Fernandez Curbelo, Luis M. Vence, Alexandre Reuben, Sarah B. Johnson, Reetakshi Arora, Golnaz Morad, Matthew Lastrapes, Erez N. Baruch, Latasha Little, Curtis Gumbs, Zachary A. Cooper, Peter A. Prieto, Khalida Wani, Alexander J. Lazar, Michael T. Tetzlaff, Courtney W. Hudgens, Margaret K. Callahan, Matthew Adamow, Michael A. Postow, Charlotte E. Ariyan, Pierre-Olivier Gaudreau, Luigi Nezi, Didier Raoult, Catalin Mihalcioiu, Arielle Elkrief, Rossanna C. Pezo, Lauren E. Haydu, Julie M. Simon, Hussein A. Tawbi, Jennifer L. McQuade, Patrick Hwu, Wen-Jen Hwu, Rodabe N. Amaria, Elizabeth M. Burton, Scott E. Woodman, Stephanie S. Watowich, Adi Diab, Sapna P. Patel, Isabella C. Glitza, Michael K.K. Wong, Li Zhao, Jianhua Zhang, Nadim J. Ajami, Joseph F. Petrosino, Robert R. Jenq, Michael A. Davies, Jeffrey E. Gershenwald, P. Andrew Futreal, Padmanee Sharma, James P. Allison, Bertrand Routy, Laurence Zitvogel, Jennifer A. Wargo

Notice bibliographique

RevueNature Medicine · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGut microbiota and health
Établissements canadiensUniversity of TorontoSunnybrook Health Science CentreMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesMoonshot Research and Development ProgramNational Cancer InstituteMedical Research CouncilUniversity of Texas MD Anderson Cancer CenterSwiss Bridge FoundationCancer Prevention and Research Institute of TexasInstitut Gustave-RoussyFondation de FranceLigue Contre le CancerHorizon 2020 Framework ProgrammeFondation pour la Recherche MédicaleCHIST-ERAAgence Nationale de la RechercheMemorial Sloan-Kettering Cancer CenterFondation PhilanthropiaAssociation pour la Recherche sur le CancerSeerave FoundationStand Up To CancerChancellerie des Universités de ParisAIM at MelanomaUniversity of TorontoMelanoma Research AllianceLabex Immuno-OncologyNational Institutes of HealthDr. Miriam and Sheldon G. Adelson Medical Research FoundationNational Health and Medical Research CouncilInstitut National Du CancerFonds de Recherche du Québec - SantéInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleE-RareAmerican Association for Cancer ResearchU.S. Department of Health and Human Services
Mots-clésCTLA-4BlockadeGut floraToxicityMedicineImmunologyBiologyInternal medicineImmune systemReceptorT cell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Treatment with combined immune checkpoint blockade (CICB) targeting CTLA-4 and PD-1 is associated with clinical benefit across tumor types, but a high rate of immune-related adverse events (irAE). Insights into biomarkers and mechanisms of response and toxicity to CICB are needed. To address this, we profiled the blood, tumor and gut microbiome of 77 advanced melanoma patients treated with CICB, with a high rate of any ≥Grade 3 irAEs (49%) with parallel studies in pre-clinical models. Tumor-associated immune and genomic biomarkers of response to CICB were similar to those identified for ICB monotherapy, and toxicity from CICB was associated with a more diverse peripheral T cell repertoire. Profiling of gut microbiota demonstrated a significantly higher abundance of Bacteroides intestinalis in patients with toxicity, with upregulation of mucosal IL-1b in patient samples of colitis and in pre-clinical models. Together, these data offer potential new therapeutic angles for targeting toxicity to CICB.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,249
Écart entre enseignants0,244 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations415
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentnon

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