TAMI-59. METABOLIC REGULATION OF THE EPIGENOME DRIVES LETHAL INFANTILE EPENDYMOMA
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Ependymomas are malignant glial tumors that occur throughout the central nervous system. Of the nine distinct molecular types of ependymoma, Posterior Fossa A(PFA) ependymomas, found in the hindbrain of infants and young children, are the most prevalent type. They rarely harbor recurrent somatic single nucleotide or copy number aberrations, but rather display epigenetic dysregulations. Transcriptional analyses show that PFAs, but not other molecular ependymoma variants, have elevated hypoxic signaling. We hypothesized that the metabolic environment of the developing human fetal hindbrain contributes to PFA ependymomas through the intermediary metabolic mechanism. Hypoxia microenvironment is essential for PFA survival and upholding their epigenetic dysregulation. Hypoxia blocks methyltransferase activity by upregulating EZHIPs expression and restricting SAM abundance. Fine-tuning the abundance of a-KG and acetyl-CoA, hypoxia fuels demethylase, and acetyltransferase activity which collectively resulting in H3K27 hypomethylation and hyperacetylation. Genome-wide essentially screen further underscore that minimal basal level of H3K27me3 is essential for PFA survival and further attenuation of H3K27me3 decreases the fitness of PFAs. PFA Ependymomas have a unique epigenome, suggesting a model in which they thrive in a narrow Goldilocks zone, with deviation to either increased or decreased H3K27me3 levels leading to diminished cellular fitness. PFAs are maintained under hypoxia, associated with restricted availability of specific metabolites to diminish histone methylation and increase histone demethylation and acetylation at H3K27. PFAs initiate from a cell lineage in the first trimester of human development that resides in restricted oxygen. Unlike other ependymomas, transient exposure of PFA cells to ambient oxygen induces irreversible cellular toxicity. PFA tumors exhibit a low basal level of H3K27me3 and, paradoxically, inhibition of H3K27 methylation specifically disrupts PFA growth. Microenvironmental regulation of PFA ependymoma epigenome appears to play a major role in tumorigenesis. Targeting metabolism and/or the epigenome presents a unique opportunity for rational therapy for infants with PFA ependymoma.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».