MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3113360743 · doi:10.1136/jitc-2020-sitc2020.0020

20 Quantification of sBCMA in human plasma using a high-throughput mass spectrometry workflow for exploratory, CAP/CLIA or regulated studies

2020· article· en· W3113360743 sur OpenAlexaff
Luca Genovesi, Michael Schirm, Gwënaël Pottiez, Rudolf Guilbaud, Lorella Di Donato

Notice bibliographique

RevueRegular and Young Investigator Award Abstracts · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMultiple Myeloma Research and Treatments
Établissements canadiensCaprion (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChemistryChromatographyMass spectrometryPeptideSelected reaction monitoringTandem mass spectrometryBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

<h3>Background</h3> Bioanalytically validated methods are needed for reliable measurement of B cell maturation antigen (BCMA) in clinical samples. BCMA contributes to multiple myeloma (MM) pathophysiology and is targeted by various novel immunotherapies. Soluble BCMA (sBCMA) is a promising novel biomarker for disease monitoring and prediction. To address the need for sBCMA measurement, we developed a mass spectrometry-based assays for the quantitation of total sBCMA in plasma. <h3>Methods</h3> Immunoaffinity enrichment of sBCMA from human plasma was performed on a Agilent AssayMap Bravo platform using streptavidin cartridges. Recovered sBCMA protein was digested to peptides using trypsin, spiked with a fixed level of stable isotope labeled (SIL) peptide standard, and analyzed by multiple-reaction-monitoring (MRM) mass spectrometry. The MRM assay targeted a BCMA-specific endogenous peptide used as a surrogate measure of the protein, as well as the corresponding spiked SIL peptide at known concentration. An 8-point external calibration curve was prepared by spiking varying amounts of recombinant BCMA and fixed amounts of SIL peptides in surrogate matrix. Endogenous sBCMA levels were determined by back-calculating against the curve. To assess the performance of the method, ≥ 2 precision and accuracy runs were performed. To assess the impact of ligand or drug binding on the developed assay, performance of the assay was tested using plasma spiked at a range of concentrations with rhAPRIL, rhBAFF or simulated mAb drug. <h3>Results</h3> The developed assay allowed the quantitation of sBCMA from 1 to 1000 ng/mL. The precision and accuracy at different QC levels was within 20% CV and 20% bias. The presence of binding proteins (rhAPRIL, rhBAFF, simulated mAb) did not interfere with the measurement of sBCMA indicating that the assay measures total sBCMA. <h3>Conclusions</h3> We have developed an assay for the absolute quantitation of total sBCMA in human plasma. The assay can be analytically validated and deployed for clinical studies with a ~ 3-day turnaround time.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,125
Score d'incertitude au seuil0,974

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,138
Tête enseignante GPT0,356
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueRegular and Young Investigator Award AbstractsMême sujetMultiple Myeloma Research and TreatmentsTravaux en français237 207