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Enregistrement W3113589313 · doi:10.1101/2020.12.23.424179

<i>On-chip</i> perivascular niche with patient-derived glioma cells

2020· preprint· en· W3113589313 sur OpenAlexaff
Magda Gerigk, Harry Bulstrode, Haotian Shi, Felix Tönisen, Camilla Cerutti, Gillian Morrison, David H. Rowitch, Yan Yan Shery Huang

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineEngineering
Thématique3D Printing in Biomedical Research
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesEngineering and Physical Sciences Research CouncilNational Institute for Health and Care ResearchCancer Research UK
Mots-clésAngiogenesisBiologyPericyteEndothelial stem cellMatrigelGliomaCancer researchCell biologyStem cellPathologyCancer stem cellMedicineIn vitro

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Glioblastoma multiforme (GBM), is the most common and the most aggressive type of primary brain malignancy. Glioblastoma stem- like cells (GSCs) are able to migrate in vascular niches within or away from the tumour mass, increasing tumour resistance to patient treatments and contributing to relapses. To study individual GSCs migration and their interactions with the microenvironment in the vasculature, there is a need to develop a model of human blood vessels in vitro . Herein, we report a systematic study on the interaction between patient-derived glioma stem- like cell lines with different organotypic perivascular niche models. A microfluidic chip integrated with an extracellular matrix was fabricated to support the culture of rounded microvessels, formed with endothelial cells from three different organs, (1) human brain microvascular endothelial cells (hCMEC/D3), (2) human umbilical vein endothelial cells (HUVECs) and, (3) human lung microvascular endothelial cells (HMVEC-L). Three-dimensional (3D) cell culture retains selected adherent and tight junction markers of the endothelial cells, and the stemness-related genes of GSCs. We optimized the experimental protocol to perform qPCR, and western blot on the co-cultured GSCs with endothelial cells forming microvessels. Endpoint biological assays showed upregulation of neovascularization-related genes in endothelial cells (e.g., angiopoietins, vascular endothelial growth factor receptors) resulted after their co-culture with GBM cells. Moreover, we measured cancer cell speed and polarization during migration towards the endothelial cell formed vessel by live-cell imaging showing that organotypic (brain cancer cells – brain endothelial microvessel) interactions differ from those within non-tissue specific vascular niches. The development and optimization of this 3D microfluidic device could provide the next level of complexity of an in vitro system to study the influence of glioma cells on normal brain endothelium. More importantly, it enables the possibility to conduct comparative studies to dissect the influence of 3D culture, microvessel architecture and organotypic vessel types on glioma cells’ stemness and migration.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,204
Écart entre enseignants0,193 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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