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Enregistrement W3115599474 · doi:10.21203/rs.3.rs-17223/v1

A novel bifunctional aldehyde/alcohol dehydrogenase mediating ethanol formation from acetyl-CoA in hyperthermophiles

2020· preprint· en· W3115599474 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueResearch Square (Research Square) · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueBiofuel production and bioconversion
Établissements canadiensUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAcetaldehydeHyperthermophileChemistryAlcohol dehydrogenaseEthanolAldehyde dehydrogenaseBiochemistryAcetic acidFermentationAlcoholEthanol fermentationEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background: Hyperthermophilic fermentation at temperatures above 80 °C allows in situ product removal to mitigate the ethanol toxicity, and reduces microbial contamination without autoclaving/cooling of feedstock. Many species of Thermotoga grow at temperatures up to 90 °C, and have enzymes to degrade and utilize lignocelluloses, which provide advantages for achieving consolidated processes of cellulosic ethanol production. However, no CoA-dependent aldehyde dehydrogenase (CoA-Aldh) from any hyperthermophiles has been documented in literature so far. The pyruvate ferredoxin oxidoreductases from hyperthermophiles have pyruvate decarboxylase activity, which convert about 2% and 98% of pyruvate to acetaldehyde and acetyl-CoA (ac-CoA), respectively. Acetyl-CoA can be converted to acetic acid, if there is no CoA-Aldh to convert ac-CoA to acetaldehyde and further to ethanol. Therefore, the current study aimed to identify and characterize a CoA-Aldh activity that mediates ethanol fermentation in hyperthermophiles. Results: In Thermotoga neapolitana ( Tne ), a hyperthermophilic iron-acetaldehyde/alcohol dehydrogenase (Fe-AAdh) was, for the first time, revealed to catalyze the ac-CoA reduction to form ethanol via an acetaldehyde intermediate, while the annotated aldh gene in Tne genome only encodes a CoA-independent Aldh that oxidizes aldehyde to acetic acid. Three other Tne alcohol dehydrogenases (Adh) exhibited specific physiological roles in ethanol formation and consumption: Fe-Adh2 mainly catalyzed the reduction of acetaldehyde to produce ethanol, and Fe-Adh1 showed significant activities only under extreme conditions, while Zn-Adh showed special activity in ethanol oxidation. In the in vitro formation of ethanol from ac-CoA, a strong synergy was observed between Fe-Adh1 and Fe-AAdh. The Fe-AAdh gene is highly conserved in Thermotoga spp. and in Pyrococus sp., which is probably responsible for ethanol metabolism in hyperthermophiles. Conclusions: Hyperthermophilic Thermotoga spp. are excellent candidates for biosynthesis of cellulosic ethanol fermentation strains. The finding of a novel hyperthermophilic CoA-Aldh activity of Tne Fe-AAdh revealed the existence of a hyperthermophilic fermentation pathway from ac-CoA to ethanol, which offers a basic frame for in vitro synthesis of a highly active AAdh for effective ethanol fermentation pathway in hyperthermophiles, which is a key element for the approach to the consolidated processes of cellulosic ethanol production.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,006
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Intégrité de la recherche, Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesIntégrité de la recherche, Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,575
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0060,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0030,003
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0010,009
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,164
Tête enseignante GPT0,368
Écart entre enseignants0,205 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle