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Enregistrement W3116039732 · doi:10.1021/acs.jmedchem.0c01547

Structure–Activity Relationship and Bioactivity of Short Analogues of ELABELA as Agonists of the Apelin Receptor

2020· article· en· W3116039732 sur OpenAlexafffund
Kien Trân, Alexandre Murza, Xavier Sainsily, Eugénie Delile, Pierre Couvineau, Jérôme Côté, David Coquerel, Maude Peloquin, Mannix Auger‐Messier, Michel Bouvier, Olivier Lesur, Philippe Sarret, Éric Marsault

Notice bibliographique

RevueJournal of Medicinal Chemistry · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueApelin-related biomedical research
Établissements canadiensInstitute for Research in Immunology and CancerUniversité de MontréalUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesFonds de Recherche du Québec - SantéCanada Foundation for InnovationNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversité de SherbrookeCanadian Institutes of Health ResearchMitacsGovernment of CanadaHeart and Stroke Foundation of Canada
Mots-clésApelinChemistryReceptorDocking (animal)StereochemistryIn vivoStructure–activity relationshipBiochemistryIn vitroBiologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ELABELA (ELA) is the second endogenous ligand of the apelin receptor (APJ). Although apelin-13 and ELA both target APJ, there is limited information on structure–activity relationship (SAR) of ELA. In the present work, we identified the shortest bioactive C-terminal fragment ELA23-32, which possesses high affinity for APJ (Ki 4.6 nM) and produces cardiorenal effects in vivo similar to those of ELA. SAR studies on conserved residues (Leu25, His26, Val29, Pro30, Phe31, Pro32) show that ELA and apelin-13 may interact differently with APJ. His26 and Val29 emerge as important for ELA binding. Docking and binding experiments suggest that Phe31 of ELA may bind to a tight groove distinct from that of Phe13 of Ape13, while the Phe13 pocket may be occupied by Pro32 of ELA. Further characterization of signaling profiles on the Gαi1, Gα12, and β-arrestin2 pathways reveals the importance of aromatic residue at the Phe31 or Pro32 position for receptor activation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,007
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,108
Score d'incertitude au seuil0,795

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,007
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,319
Écart entre enseignants0,285 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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