Transcriptomic profiling of <i>Brassica napus</i> responses to <i>Pseudomonas aeruginosa</i>
Pourquoi ce travail est dans la base
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Notice bibliographique
Résumé
Pseudomonas aeruginosa is an opportunistic bacterial pathogen of plants. Unlike the well-characterized plant defense responses to highly adapted bacterial phytopathogens, little is known about plant response to P. aeruginosa infection. In this study, we examined the Brassica napus (canola) tissue-specific response to P. aeruginosa infection using RNA sequencing. Transcriptomic analysis of canola seedlings over a 5 day P. aeruginosa infection revealed that many molecular processes involved in plant innate immunity were up-regulated, whereas photosynthesis was down-regulated. Phytohormones control many vital biological processes within plants, including growth and development, senescence, seed setting, fruit ripening, and innate immunity. The three main phytohormones involved in plant innate immunity are salicylic acid (SA), jasmonic acid (JA), and ethylene (ET). Many bacterial pathogens have evolved multiple strategies to manipulate these hormone responses in order to infect plants successfully. Interestingly, gene expression within all three phytohormone (SA, JA, and ET) signaling pathways was up-regulated in response to P. aeruginosa infection. This study identified a unique plant hormone response to the opportunistic bacterial pathogen P. aeruginosa infection.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle