Genotyping and antimicrobial resistance patterns of Mannheimia haemolytica, Pasteurella multocida and Histophilus somni isolated from the upper and lower respiratory tract of feedlot cattle
Notice bibliographique
Résumé
In the last 10 years, the prevalence of Pasteurellaceae resistant against drugs typically used for bronchopneumonia (BP) control has increased in feedlot cattle. Surprisingly, it is not clear whether this increase in the prevalence of multidrug resistant (MDR) bacteria is due to the spread of 1 or few multiple MDR clones among cattle during the feeding period (i.e. horizontal spread) or due to the recrudescence of MDR clones already present in the respiratory tract of cattle upon arrival at feedlots. Recently, we reported a high prevalence of MDR M. haemolytica, P. multocida, and H. somni isolated from cattle with BP in 4 feedlots in Western Canada. Unfortunately, as we did not genotype these isolates, it was not possible to determine whether a few or a large number of MDR clones were present in these feedlots, supporting either a horizontal spread of MDR clones among cattle or a recrudescence from carriers. Therefore, the objective was to genotype M. haemolytica, P. multocida, and H. somni isolates using pulsed field gel electrophoresis (PFGE).
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».